More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1116 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1116  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  100 
 
 
372 aa  768    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0035245  unclonable  0.0000000557306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1988  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  71.23 
 
 
373 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.917829  normal  0.0553009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3266  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  70.91 
 
 
385 aa  531  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3378  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  45.38 
 
 
386 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.834963  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.78 
 
 
394 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.55 
 
 
370 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.42 
 
 
375 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
399 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.6 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.67 
 
 
376 aa  243  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.64 
 
 
374 aa  243  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
374 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
374 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
377 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
374 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.6 
 
 
378 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.1 
 
 
395 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.95 
 
 
397 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.95 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.95 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.4 
 
 
472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.95 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.72 
 
 
374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.95 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.57 
 
 
395 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
374 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
375 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
375 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
375 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
375 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
375 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
375 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
375 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
374 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.26 
 
 
371 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  38.16 
 
 
375 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
375 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.57 
 
 
395 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.83 
 
 
395 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.57 
 
 
395 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.67 
 
 
397 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.67 
 
 
367 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.6 
 
 
383 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.46 
 
 
370 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.88 
 
 
374 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
374 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.6 
 
 
383 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.88 
 
 
374 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.88 
 
 
374 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
377 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.04 
 
 
447 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.88 
 
 
374 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.5 
 
 
391 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.27 
 
 
374 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.76 
 
 
370 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.27 
 
 
374 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.27 
 
 
374 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.29 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.01 
 
 
373 aa  236  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.1 
 
 
374 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.48 
 
 
367 aa  236  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
379 aa  235  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.01 
 
 
372 aa  235  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
381 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.09 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  36.78 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.01 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.6 
 
 
374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.78 
 
 
376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.88 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.6 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.33 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.6 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0320  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.46 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.67 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.18 
 
 
371 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.54 
 
 
374 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.52 
 
 
374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.38 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.38 
 
 
368 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.96 
 
 
374 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.8 
 
 
370 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.03 
 
 
399 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.24 
 
 
373 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.92 
 
 
368 aa  232  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.73 
 
 
370 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0466  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.27 
 
 
398 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114256  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.24 
 
 
385 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.62 
 
 
355 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3143  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.9 
 
 
390 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
396 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.26 
 
 
395 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.57 
 
 
400 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3870  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.73 
 
 
390 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.550256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>