More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2484 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2484  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
384 aa  777    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668988  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0251  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.97 
 
 
434 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  32.86 
 
 
445 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.52 
 
 
442 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  31.29 
 
 
442 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.52 
 
 
442 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  31.52 
 
 
442 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.75 
 
 
442 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.75 
 
 
442 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  31.75 
 
 
442 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.57 
 
 
442 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.97 
 
 
442 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  31.52 
 
 
442 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  30.88 
 
 
442 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  32.22 
 
 
441 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.4 
 
 
447 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.77 
 
 
433 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  32.94 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.95 
 
 
452 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.9 
 
 
430 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.64 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.82 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.54 
 
 
453 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  29.4 
 
 
412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.93 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  29.33 
 
 
433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.84 
 
 
445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  32.46 
 
 
435 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  29.63 
 
 
425 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  29.95 
 
 
438 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.34 
 
 
465 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.43 
 
 
447 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.67 
 
 
447 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.64 
 
 
543 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  31.13 
 
 
428 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.31 
 
 
413 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  27.08 
 
 
450 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  29.68 
 
 
453 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.37 
 
 
442 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  29.47 
 
 
507 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.43 
 
 
440 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  31.02 
 
 
413 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  29.67 
 
 
431 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.4 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.61 
 
 
453 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.63 
 
 
463 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  29.47 
 
 
458 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  29.46 
 
 
416 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  30.62 
 
 
416 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.16 
 
 
433 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  31.01 
 
 
433 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  31.16 
 
 
433 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.32 
 
 
471 aa  149  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  30.88 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.22 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  28.04 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.92 
 
 
445 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  28.91 
 
 
446 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  29.12 
 
 
437 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  29.23 
 
 
434 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  29.69 
 
 
430 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  30.35 
 
 
447 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.68 
 
 
474 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  30.24 
 
 
432 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.04 
 
 
439 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.92 
 
 
402 aa  143  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.49 
 
 
423 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.16 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.88 
 
 
449 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.63 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.32 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.84 
 
 
447 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.88 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.44 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.29 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1901  hypothetical protein  28.75 
 
 
445 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.23 
 
 
408 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.54 
 
 
408 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.74 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.39 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2792  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.43 
 
 
417 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000832381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  29.1 
 
 
472 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.42 
 
 
408 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.52 
 
 
408 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  25.86 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.5 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.62 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0339  hypothetical protein  28.88 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.47 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.47 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.42 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.47 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.96 
 
 
408 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.96 
 
 
408 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.01 
 
 
408 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.59 
 
 
422 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.96 
 
 
408 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.96 
 
 
408 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.01 
 
 
408 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.2 
 
 
443 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>