74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1782 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1782  stage IV sporulation protein B  100 
 
 
386 aa  767    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2068  stage IV sporulation protein B  95.85 
 
 
386 aa  697    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1895  stage IV sporulation protein B  45.63 
 
 
441 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000549397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4077  stage IV sporulation protein B  44.48 
 
 
432 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00819941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4396  stage IV sporulation protein B  44.48 
 
 
432 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0934339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4245  stage IV sporulation protein B  44.16 
 
 
432 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0105782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3915  stage IV sporulation protein B  44.16 
 
 
432 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3926  stage IV sporulation protein B  44.16 
 
 
432 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4303  stage IV sporulation protein B  44.16 
 
 
429 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4025  peptidase S55 sporulation stage IV protein B  44.62 
 
 
430 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4193  stage IV sporulation protein B  44.48 
 
 
429 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82677e-30 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1545  peptidase S55, SpoIVB  47.1 
 
 
437 aa  285  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0951  stage IV sporulation protein B  45.74 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.036128  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2866  peptidase S55 sporulation stage IV protein B  45.11 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4283  stage IV sporulation protein B  45.74 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0813  SpoIVB peptidase  44.34 
 
 
446 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2315  stage IV sporulation protein B  40.05 
 
 
430 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.408838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0255  stage IV sporulation protein B  44.94 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3482  stage IV sporulation protein B  41.64 
 
 
419 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1085  peptidase S55, SpoIVB  41.25 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1616  peptidase S55, SpoIVB  37.58 
 
 
440 aa  239  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1506  SpoIVB peptidase  38.05 
 
 
440 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1690  stage IV sporulation protein B  39.62 
 
 
433 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2578  stage IV sporulation protein B  39.22 
 
 
471 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.519202 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06580  Peptidase S55 sporulation stage IV protein B  38.39 
 
 
434 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000287933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0589  hypothetical protein  37.62 
 
 
443 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1768  stage IV sporulation protein B  36.93 
 
 
416 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2498  stage IV sporulation protein B  38.73 
 
 
445 aa  212  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1336  stage IV sporulation protein B  38.02 
 
 
413 aa  212  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1393  stage IV sporulation protein B  33.43 
 
 
447 aa  206  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.4 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  23.48 
 
 
450 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  24.78 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.11 
 
 
335 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  35.06 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.11 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.32 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  31.58 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  32.81 
 
 
516 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  31.58 
 
 
353 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.43 
 
 
339 aa  46.2  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28 
 
 
446 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  35.38 
 
 
491 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  33.87 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  34.62 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.51 
 
 
480 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  28.97 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  36.99 
 
 
523 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  34.88 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  30.91 
 
 
447 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  26.32 
 
 
522 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4524  PDZ/DHR/GLGF  24.48 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  36.23 
 
 
442 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  26.83 
 
 
451 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  29.41 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.91 
 
 
450 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.09 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.92 
 
 
450 aa  43.9  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  31.58 
 
 
496 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  30.26 
 
 
336 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  31.25 
 
 
477 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  30.77 
 
 
379 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  32.89 
 
 
497 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  35.53 
 
 
355 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.03 
 
 
450 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  32.89 
 
 
497 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  31.25 
 
 
492 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  31.88 
 
 
354 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  30.77 
 
 
498 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.36 
 
 
455 aa  42.7  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  30.65 
 
 
451 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  30.12 
 
 
492 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>