45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0813 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0813  SpoIVB peptidase  100 
 
 
446 aa  896    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1895  stage IV sporulation protein B  54 
 
 
441 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000549397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1545  peptidase S55, SpoIVB  42.68 
 
 
437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2315  stage IV sporulation protein B  40.45 
 
 
430 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.408838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1085  peptidase S55, SpoIVB  42.23 
 
 
445 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0255  stage IV sporulation protein B  40.49 
 
 
431 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2068  stage IV sporulation protein B  45.63 
 
 
386 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06580  Peptidase S55 sporulation stage IV protein B  37.29 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000287933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2498  stage IV sporulation protein B  38.02 
 
 
445 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1782  stage IV sporulation protein B  44.34 
 
 
386 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3915  stage IV sporulation protein B  36.64 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3926  stage IV sporulation protein B  36.64 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4077  stage IV sporulation protein B  36.64 
 
 
432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00819941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4303  stage IV sporulation protein B  38.44 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4245  stage IV sporulation protein B  36.64 
 
 
432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0105782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4396  stage IV sporulation protein B  36.64 
 
 
432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0934339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4193  stage IV sporulation protein B  36.66 
 
 
429 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82677e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0951  stage IV sporulation protein B  36.49 
 
 
429 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.036128  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1616  peptidase S55, SpoIVB  41.72 
 
 
440 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4283  stage IV sporulation protein B  36.49 
 
 
429 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1506  SpoIVB peptidase  40.33 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2866  peptidase S55 sporulation stage IV protein B  36.19 
 
 
432 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4025  peptidase S55 sporulation stage IV protein B  35.71 
 
 
430 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3482  stage IV sporulation protein B  39.76 
 
 
419 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0589  hypothetical protein  40 
 
 
443 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1393  stage IV sporulation protein B  39.39 
 
 
447 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2578  stage IV sporulation protein B  42.9 
 
 
471 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.519202 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1336  stage IV sporulation protein B  37.56 
 
 
413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1690  stage IV sporulation protein B  32.94 
 
 
433 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1768  stage IV sporulation protein B  38.67 
 
 
416 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  32.08 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.91 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  33.66 
 
 
428 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 
405 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  33.71 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  36.99 
 
 
527 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.41 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.03 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  34.12 
 
 
1092 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.56 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.46 
 
 
428 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.14 
 
 
357 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.82 
 
 
385 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.09 
 
 
347 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  29.63 
 
 
402 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>