154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01110 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN01110  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07668  GAF domain nucleotide-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01360)  41.41 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.156532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4000  sensor protein  40.83 
 
 		 162 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48539  predicted protein  42.02 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.07066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2722  putative GAF sensor protein  44.97 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1028  putative GAF sensor protein  40.46 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2019  GAF domain-containing protein  38.42 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3274  sensor protein  39.53 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.622071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1276  putative sensor with GAF domain  40.24 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4397  hypothetical protein  43.86 
 
 		 159 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1032  putative GAF sensor protein  40.46 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4790  hypothetical protein  43.27 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4552  hypothetical protein  43.27 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4387  hypothetical protein  43.27 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4788  hypothetical protein  43.27 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00635993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4905  hypothetical protein  43.27 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4771  hypothetical protein  43.27 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4262  putative GAF sensor protein  39.88 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2155  putative GAF sensor protein  39.44 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0330363  normal  0.417247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0671  putative GAF sensor protein  39.77 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1150  putative GAF sensor protein  39.77 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4762  hypothetical protein  42.69 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.01469  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3834  putative GAF sensor protein  39.05 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.385875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0473  hypothetical protein  42.69 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.253939  hitchhiker  3.4768e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4483  putative GAF sensor protein  42.69 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1126  putative GAF sensor protein  38.64 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00168904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2076  putative GAF sensor protein  40.83 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.924433  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0904  GAF domain-containing protein  37.8 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3325  GAF domain-containing protein  40.23 
 
 		 159 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0820  putative GAF sensor protein  39.39 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.180323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3977  sensor protein  39.53 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1843  putative GAF sensor protein  40.94 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5928  GAF domain-containing protein  39.76 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1486  hypothetical protein  38.82 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0475  GAF domain-containing protein  36.97 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000747602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2111  GAF domain-containing protein  38.69 
 
 		 157 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2117  putative GAF sensor protein  41.82 
 
 		 165 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00785932  hitchhiker  0.000244904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1282  GAF domain-containing protein  37.21 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000115739  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6399  putative GAF sensor protein  38.69 
 
 		 163 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0717  putative GAF sensor protein  42.86 
 
 		 158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1851  putative GAF sensor protein  39.64 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1877  GAF domain-containing protein  38.79 
 
 		 160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3838  GAF domain-containing protein  38.79 
 
 		 160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220762  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2103  putative GAF sensor protein  40.35 
 
 		 155 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1990  putative GAF sensor protein  34.91 
 
 		 154 aa  111  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0273929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2230  putative GAF sensor protein  37.65 
 
 		 154 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0464  putative GAF sensor protein  37.43 
 
 		 160 aa  111  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000576778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1720  GAF domain-containing protein  38.46 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000034795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1800  putative GAF sensor protein  39.52 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1452  hypothetical protein  37.65 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal  0.188383 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2603  hypothetical protein  39.18 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0130  putative GAF sensor protein  38.24 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1583  GAF domain-containing protein  39.88 
 
 		 153 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3668  putative GAF sensor protein  36.61 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000365673  normal  0.0790972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2139  putative GAF sensor protein  39.05 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2204  putative GAF sensor protein  41.1 
 
 		 152 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.707038  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1203  putative GAF sensor protein  35.87 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1784  GAF domain protein  38.24 
 
 		 160 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01999  GAF domain-containing protein  36.36 
 
 		 151 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0371  putative GAF sensor protein  36.26 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33263  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1746  putative GAF sensor protein  39.88 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.698368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1776  putative GAF sensor protein  39.88 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0635695  normal  0.0905724 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1774  hypothetical protein  39.24 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00245693  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1925  GAF domain-containing protein  37.43 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000712217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1809  GAF domain-containing protein  39.24 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000874323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1745  GAF domain-containing protein  35.67 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1671  putative GAF sensor protein  39.88 
 
 		 152 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000389411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1670  hypothetical protein  40.12 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000032114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1355  GAF domain-containing protein  36.93 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000310467  normal  0.246398 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19110  GAF domain-containing protein  38.55 
 
 		 162 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000206028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2665  hypothetical protein  40.12 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000471553  normal  0.0325611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1781  hypothetical protein  40.12 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01803  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1542  hypothetical protein  37.34 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2879  hypothetical protein  35.67 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01791  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2100  GAF domain protein  36.16 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000646047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2764  hypothetical protein  35.67 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2823  hypothetical protein  35.67 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1923  GAF domain-containing protein  36.36 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2061  GAF domain-containing protein  36.36 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1810  putative GAF sensor protein  35.8 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2452  hypothetical protein  35.67 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2829  hypothetical protein  35.67 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0190862  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0097  putative GAF sensor protein  35.33 
 
 		 147 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.060889 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  105  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1106  hypothetical protein  37.58 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124108  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03142  possible Sensor with GAF domain  37.28 
 
 		 162 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2333  sensor protein  39.1 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1933  putative GAF sensor protein  39.76 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3610  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0239404  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2565  GAF domain protein  36.26 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000383818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1775  hypothetical protein  35.09 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2402  putative GAF sensor protein  35.76 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1902  putative GAF sensor protein  39.26 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044127  normal  0.123566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1800  putative GAF sensor protein  36.26 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657978  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1826  GAF domain-containing protein  33.94 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02348  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27570  GAF domain-containing protein  38.46 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759844  decreased coverage  0.00184503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1913  putative GAF sensor protein  38.22 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0613802  normal  0.650392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>