86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI03410 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI03410  iron hydrogenase, putative  100 
 
 
650 aa  1351    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03632  iron-sulfur cluster assembly associated protein Nar1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11960)  33.02 
 
 
590 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.436133 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33268  nuclear architecture related protein  33.59 
 
 
545 aa  222  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33837  predicted protein  35.05 
 
 
473 aa  210  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.40604 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  27.55 
 
 
667 aa  108  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  38.89 
 
 
577 aa  108  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  33.06 
 
 
582 aa  105  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  33.06 
 
 
582 aa  105  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
410 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  37.29 
 
 
410 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  23.47 
 
 
644 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  40.43 
 
 
578 aa  102  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  39.44 
 
 
523 aa  102  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  36.72 
 
 
410 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  26.99 
 
 
579 aa  100  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  27.73 
 
 
582 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  32.37 
 
 
659 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  27.51 
 
 
574 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  28.45 
 
 
666 aa  99.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  41.13 
 
 
573 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  30.29 
 
 
582 aa  99.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  33.91 
 
 
596 aa  98.6  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  37.59 
 
 
421 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  38.61 
 
 
593 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48846  predicted protein  29.04 
 
 
627 aa  97.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  28.17 
 
 
606 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  38.69 
 
 
581 aa  96.3  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  36.18 
 
 
653 aa  95.9  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  30.54 
 
 
585 aa  95.5  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  33.48 
 
 
458 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  33.54 
 
 
578 aa  94.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  34.21 
 
 
417 aa  94.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  34.05 
 
 
590 aa  94.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  36.23 
 
 
418 aa  94  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  37.14 
 
 
576 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  27.84 
 
 
696 aa  93.6  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  35.44 
 
 
583 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  28.57 
 
 
696 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  31.47 
 
 
574 aa  92  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  36.5 
 
 
580 aa  92  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  26.55 
 
 
1150 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  37.68 
 
 
585 aa  91.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  38.69 
 
 
573 aa  91.3  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  31.16 
 
 
573 aa  91.3  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  31.61 
 
 
581 aa  91.3  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  28.88 
 
 
582 aa  90.9  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  36.96 
 
 
573 aa  90.1  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  33.74 
 
 
573 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  36.5 
 
 
513 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  29.05 
 
 
644 aa  89.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  29.18 
 
 
570 aa  89  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  37.06 
 
 
520 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  28.24 
 
 
598 aa  88.2  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  33.78 
 
 
527 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  33.54 
 
 
578 aa  87.4  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  30.53 
 
 
563 aa  87.4  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  27.73 
 
 
566 aa  87  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  33.33 
 
 
421 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  36.5 
 
 
615 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  27.59 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  27.47 
 
 
572 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  34.48 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  35.06 
 
 
549 aa  85.5  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  36.17 
 
 
582 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  36.17 
 
 
569 aa  84.3  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  34.78 
 
 
582 aa  82.8  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  35.15 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  25.39 
 
 
601 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  29 
 
 
585 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  32.86 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  33.58 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  25.88 
 
 
645 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  25.88 
 
 
645 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  32.39 
 
 
587 aa  80.1  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  32.41 
 
 
587 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  35.46 
 
 
582 aa  79.7  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  23.95 
 
 
625 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  31.85 
 
 
666 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  25.86 
 
 
567 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  31.69 
 
 
594 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  30.99 
 
 
586 aa  75.1  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  26.78 
 
 
569 aa  71.6  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  33.33 
 
 
619 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  28.74 
 
 
462 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  26.7 
 
 
435 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  24.82 
 
 
493 aa  43.9  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>