More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04400 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04400  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  651    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01348  50S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G09410)  38.1 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 		 141 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  42.21 
 
 		 168 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  41.56 
 
 		 168 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  43.59 
 
 		 129 aa  109  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  43.87 
 
 		 132 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  41.77 
 
 		 132 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  41.56 
 
 		 158 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  40.91 
 
 		 164 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  43.23 
 
 		 131 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  40.26 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  40.91 
 
 		 162 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  43.23 
 
 		 131 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  43.59 
 
 		 131 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  40.91 
 
 		 184 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  38.75 
 
 		 142 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  41.29 
 
 		 132 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  42.58 
 
 		 132 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  42.31 
 
 		 130 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  41.67 
 
 		 132 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  42.31 
 
 		 130 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  41.77 
 
 		 133 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  39.61 
 
 		 175 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 138 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  42.31 
 
 		 131 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 131 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 131 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 131 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  40.51 
 
 		 129 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 131 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 131 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 131 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 131 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  40.91 
 
 		 146 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  38.96 
 
 		 124 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 131 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 131 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  36.88 
 
 		 141 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  38.31 
 
 		 140 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  41.29 
 
 		 131 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  38.12 
 
 		 142 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  41.29 
 
 		 131 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  37.01 
 
 		 155 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  41.29 
 
 		 131 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  38.12 
 
 		 142 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  38.31 
 
 		 140 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  40.26 
 
 		 132 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  41.29 
 
 		 131 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  41.29 
 
 		 131 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  41.29 
 
 		 131 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  40.26 
 
 		 143 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  40.38 
 
 		 132 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  38.96 
 
 		 141 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  40.38 
 
 		 132 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  37.66 
 
 		 138 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  40.38 
 
 		 137 aa  99.4  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0793  50S ribosomal protein L17  35.95 
 
 		 142 aa  99.4  8e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.588125  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  39.61 
 
 		 140 aa  99  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  37.11 
 
 		 140 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  39.38 
 
 		 136 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  38.36 
 
 		 141 aa  99  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  38.31 
 
 		 135 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  38.75 
 
 		 139 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  37.66 
 
 		 140 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  37.25 
 
 		 151 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  39.74 
 
 		 131 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  38.96 
 
 		 129 aa  97.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  43.15 
 
 		 128 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  39.53 
 
 		 134 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  38.96 
 
 		 129 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  36.88 
 
 		 142 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  37.82 
 
 		 134 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  41.03 
 
 		 131 aa  96.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  38.12 
 
 		 138 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  38.56 
 
 		 117 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  38.75 
 
 		 137 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  42.18 
 
 		 113 aa  95.5  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  39.22 
 
 		 130 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  40.38 
 
 		 128 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  37.91 
 
 		 117 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  38.31 
 
 		 127 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  38.31 
 
 		 130 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  38.12 
 
 		 138 aa  94  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  35.71 
 
 		 138 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  41.03 
 
 		 132 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  38.31 
 
 		 130 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  39.22 
 
 		 131 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  36.88 
 
 		 141 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  35.71 
 
 		 138 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  40.38 
 
 		 127 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  36.88 
 
 		 140 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  37.82 
 
 		 133 aa  93.2  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  37.14 
 
 		 139 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  37.14 
 
 		 139 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  38.31 
 
 		 139 aa  92.8  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  35.85 
 
 		 137 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  35.71 
 
 		 138 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  39.73 
 
 		 112 aa  92.8  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  38.31 
 
 		 119 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>