More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02760 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC02760  glyoxylate reductase, putative  100 
 
 
345 aa  709    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  38.69 
 
 
319 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  39.29 
 
 
339 aa  224  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  38.73 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  35.71 
 
 
334 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  36.31 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  36.39 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  39.71 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  36.09 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  37.13 
 
 
318 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  35.5 
 
 
322 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.31 
 
 
327 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  38.35 
 
 
321 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  36.05 
 
 
322 aa  186  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2807  glyoxylate reductase  39.05 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.949498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01500  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  37.46 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6779  Glyoxylate reductase  38.69 
 
 
327 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  34.82 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  34.93 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  33.92 
 
 
323 aa  179  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  34.82 
 
 
326 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0167  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41 
 
 
324 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  36.66 
 
 
322 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4455  Gluconate 2-dehydrogenase  41.52 
 
 
320 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  34.32 
 
 
339 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  32.45 
 
 
341 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  32.73 
 
 
328 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  41.22 
 
 
326 aa  176  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  41.22 
 
 
326 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  34.88 
 
 
323 aa  175  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  35.78 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0055  Gluconate 2-dehydrogenase  40.36 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.86 
 
 
326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4173  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.07 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1909  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  32.14 
 
 
325 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.58 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  34.22 
 
 
340 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0038  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.45 
 
 
320 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  38.94 
 
 
323 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  35.33 
 
 
323 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  34.82 
 
 
317 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5009  Glyoxylate reductase  38.69 
 
 
345 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  34.15 
 
 
328 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.55 
 
 
324 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  34.23 
 
 
323 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  38.85 
 
 
325 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0273  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  35.99 
 
 
325 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.443724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  39.39 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  39.39 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  40.53 
 
 
321 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  39.39 
 
 
325 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.13 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3322  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.11 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.02 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  36.52 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.37 
 
 
328 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0846  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.24 
 
 
326 aa  164  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.908652  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.83 
 
 
322 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  31.45 
 
 
320 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  32.52 
 
 
319 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  32.52 
 
 
319 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  35.17 
 
 
321 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5274  2-oxo-carboxylic acid reductase  34.71 
 
 
312 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.060583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2002  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  35.47 
 
 
321 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2048  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  35.47 
 
 
321 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1209  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  40.82 
 
 
325 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0763  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.64 
 
 
321 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.43 
 
 
338 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.43 
 
 
334 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  31.53 
 
 
328 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0625  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.49 
 
 
322 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  33.13 
 
 
334 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6845  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.92 
 
 
321 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  33.13 
 
 
334 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.73 
 
 
321 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0193  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.69 
 
 
329 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3531  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.97 
 
 
315 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212714  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  36.6 
 
 
321 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  32.63 
 
 
329 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13500  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  40.45 
 
 
325 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  36.6 
 
 
321 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  38.24 
 
 
324 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  35.1 
 
 
331 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  37 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1731  gluconate 2-dehydrogenase  37 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  31.44 
 
 
328 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1744  gluconate 2-dehydrogenase  37 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1121  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.64 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.465327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0692  Gluconate 2-dehydrogenase  38.38 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108341  normal  0.227497 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5114  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  33.66 
 
 
323 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0040  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  35.69 
 
 
315 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.136717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.81 
 
 
337 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.81 
 
 
324 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  32.83 
 
 
334 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3841  2-ketogluconate reductase  35 
 
 
324 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  36.56 
 
 
332 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3860  2-ketogluconate reductase  35.47 
 
 
324 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3969  2-ketogluconate reductase  35.85 
 
 
324 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3925  2-ketogluconate reductase  35.47 
 
 
324 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4029  2-ketogluconate reductase  35.47 
 
 
324 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0243111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>