More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1251 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
322 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  82.13 
 
 
321 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  81.19 
 
 
321 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  78.19 
 
 
321 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  78.5 
 
 
321 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  78.26 
 
 
321 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  77.57 
 
 
321 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  77.57 
 
 
321 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1731  gluconate 2-dehydrogenase  77.57 
 
 
321 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  75 
 
 
325 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  75 
 
 
325 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  74.69 
 
 
325 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  75 
 
 
325 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1744  gluconate 2-dehydrogenase  77.26 
 
 
321 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  72.9 
 
 
324 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0692  Gluconate 2-dehydrogenase  72.05 
 
 
324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108341  normal  0.227497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6845  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  62.78 
 
 
321 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  59.44 
 
 
326 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  59.44 
 
 
326 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  57.1 
 
 
324 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  57.1 
 
 
324 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  57.1 
 
 
324 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  57.1 
 
 
324 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  57.1 
 
 
324 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  57.1 
 
 
324 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  57.1 
 
 
324 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  59.13 
 
 
326 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  56.79 
 
 
324 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  57.59 
 
 
325 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  56.79 
 
 
324 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0167  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  56.75 
 
 
324 aa  359  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2571  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  57.99 
 
 
321 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24433  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3841  2-ketogluconate reductase  56.88 
 
 
324 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3969  2-ketogluconate reductase  56.52 
 
 
324 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4029  2-ketogluconate reductase  56.88 
 
 
324 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0243111  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3925  2-ketogluconate reductase  56.88 
 
 
324 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3860  2-ketogluconate reductase  56.56 
 
 
324 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3376  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  57.05 
 
 
320 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.555118  normal  0.118844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3708  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  53.09 
 
 
327 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.971324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26910  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  55.84 
 
 
329 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0278379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2382  gluconate 2-dehydrogenase  56.11 
 
 
320 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54026  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2568  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  55.8 
 
 
320 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00217021  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4455  Gluconate 2-dehydrogenase  55.73 
 
 
320 aa  342  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4173  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  55.42 
 
 
320 aa  338  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  53.63 
 
 
328 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  53 
 
 
328 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0055  Gluconate 2-dehydrogenase  53.7 
 
 
321 aa  332  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0038  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  52.63 
 
 
320 aa  329  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0936  2-hydroxyacid dehydrogenase  53.73 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0273  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  54.02 
 
 
325 aa  325  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.443724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0864  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  54.04 
 
 
324 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1043  2-hydroxyacid dehydrogenase  53.42 
 
 
324 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.344903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2904  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  51.41 
 
 
322 aa  315  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1215  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  52.48 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13500  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  51.24 
 
 
325 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4462  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  51.55 
 
 
324 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1261  2-hydroxyacid dehydrogenase  51.55 
 
 
324 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829817  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4585  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  51.86 
 
 
324 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177962  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1209  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  50.93 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30550  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  51.84 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.38 
 
 
337 aa  299  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3413  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  52.88 
 
 
328 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1485  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  51.27 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.87 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  46.6 
 
 
327 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  46.88 
 
 
320 aa  278  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1736  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  51.11 
 
 
335 aa  278  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5042  gluconate 2-dehydrogenase  47.8 
 
 
320 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.48 
 
 
330 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  47.48 
 
 
330 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4613  gluconate 2-dehydrogenase  47.48 
 
 
330 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4773  gluconate 2-dehydrogenase  47.17 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5135  gluconate 2-dehydrogenase  47.17 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.17 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0199  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.17 
 
 
330 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5035  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.48 
 
 
330 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.341371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4725  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.86 
 
 
320 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2771  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  50.16 
 
 
321 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2000  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.8 
 
 
318 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580581  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  45.48 
 
 
324 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  40.98 
 
 
334 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  45.26 
 
 
319 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  46.01 
 
 
331 aa  248  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  46.6 
 
 
327 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  42.19 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.54 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  51.31 
 
 
341 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  41.88 
 
 
322 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.51 
 
 
323 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  40.84 
 
 
339 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.18 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  46.49 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.17 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  44.59 
 
 
317 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1062  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.25 
 
 
329 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558591  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0624  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.25 
 
 
329 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1103  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.25 
 
 
329 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  44.1 
 
 
348 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6779  Glyoxylate reductase  39.94 
 
 
327 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  43.73 
 
 
357 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>