More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1909 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1909  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
325 aa  668    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6779  Glyoxylate reductase  49.85 
 
 
327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  41.38 
 
 
319 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  38.12 
 
 
322 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  37.81 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  38.15 
 
 
334 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  38.63 
 
 
327 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  39.69 
 
 
317 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  39.05 
 
 
324 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.44 
 
 
326 aa  227  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.06 
 
 
323 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0038  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.21 
 
 
320 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  34.25 
 
 
341 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4455  Gluconate 2-dehydrogenase  39.19 
 
 
320 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.69 
 
 
324 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  42.96 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  37.39 
 
 
324 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  37.39 
 
 
324 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  37.39 
 
 
324 aa  215  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3925  2-ketogluconate reductase  38.24 
 
 
324 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4029  2-ketogluconate reductase  38.24 
 
 
324 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0243111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  37.39 
 
 
324 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  37.39 
 
 
324 aa  215  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  37.39 
 
 
324 aa  215  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3969  2-ketogluconate reductase  38.24 
 
 
324 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0055  Gluconate 2-dehydrogenase  37.45 
 
 
321 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2722  Glyoxylate reductase  35.53 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  37.39 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3860  2-ketogluconate reductase  38.24 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4173  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.46 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  37.08 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.15 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  34.15 
 
 
340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  37.04 
 
 
339 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.23 
 
 
323 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3841  2-ketogluconate reductase  37.87 
 
 
324 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  36.53 
 
 
327 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.1 
 
 
325 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.94 
 
 
318 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2904  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.39 
 
 
322 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  34.26 
 
 
326 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  34.26 
 
 
326 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  35.44 
 
 
318 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.52 
 
 
319 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  34.52 
 
 
319 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.95 
 
 
326 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.36 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  35.42 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  37.41 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.15 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3708  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.46 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.971324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  37.58 
 
 
321 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0273  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.55 
 
 
325 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.443724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  35 
 
 
319 aa  198  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.79 
 
 
321 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.72 
 
 
328 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0167  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  37.09 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  37 
 
 
325 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  37 
 
 
325 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.25 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  36.73 
 
 
328 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  36.68 
 
 
319 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  37 
 
 
325 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  37.92 
 
 
325 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  35.51 
 
 
322 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  36.43 
 
 
321 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  36.36 
 
 
320 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  34.48 
 
 
321 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5042  gluconate 2-dehydrogenase  37.98 
 
 
320 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30550  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  35.69 
 
 
326 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26910  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  37.04 
 
 
329 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0278379  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  34.95 
 
 
331 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.33 
 
 
332 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000514509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36 
 
 
322 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5035  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  38.33 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.341371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  36.07 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0199  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  38.33 
 
 
330 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  37.98 
 
 
330 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  35.9 
 
 
320 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000853458  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  36.07 
 
 
321 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1744  gluconate 2-dehydrogenase  36.07 
 
 
321 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1731  gluconate 2-dehydrogenase  36.07 
 
 
321 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  37.63 
 
 
330 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13500  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  37.26 
 
 
325 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  36.7 
 
 
321 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0692  Gluconate 2-dehydrogenase  37.05 
 
 
324 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108341  normal  0.227497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.11 
 
 
337 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  34.87 
 
 
330 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4613  gluconate 2-dehydrogenase  37.63 
 
 
330 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  35.14 
 
 
315 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2571  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.64 
 
 
321 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24433  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4773  gluconate 2-dehydrogenase  37.63 
 
 
330 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5135  gluconate 2-dehydrogenase  37.63 
 
 
330 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1209  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  36.36 
 
 
325 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2807  glyoxylate reductase  37.06 
 
 
321 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.949498 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  37.63 
 
 
330 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  34.37 
 
 
339 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  36.21 
 
 
332 aa  185  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  35.83 
 
 
320 aa  185  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>