More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0055 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0055  Gluconate 2-dehydrogenase  100 
 
 
321 aa  659    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0038  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  85.58 
 
 
320 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4455  Gluconate 2-dehydrogenase  76.18 
 
 
320 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4173  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  76.49 
 
 
320 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  73.54 
 
 
325 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  70.9 
 
 
326 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  70.9 
 
 
326 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  70.59 
 
 
326 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  67.08 
 
 
324 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  67.08 
 
 
324 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  67.08 
 
 
324 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3969  2-ketogluconate reductase  67.6 
 
 
324 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  67.08 
 
 
324 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0167  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  67.08 
 
 
324 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  67.08 
 
 
324 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  67.08 
 
 
324 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  67.08 
 
 
324 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  66.77 
 
 
324 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3925  2-ketogluconate reductase  67.6 
 
 
324 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  66.77 
 
 
324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4029  2-ketogluconate reductase  67.6 
 
 
324 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0243111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3860  2-ketogluconate reductase  67.29 
 
 
324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3841  2-ketogluconate reductase  66.98 
 
 
324 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  57.94 
 
 
321 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  57.63 
 
 
321 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  57.37 
 
 
324 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  56.39 
 
 
321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1744  gluconate 2-dehydrogenase  56.39 
 
 
321 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  57.05 
 
 
321 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  56.39 
 
 
321 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1731  gluconate 2-dehydrogenase  56.39 
 
 
321 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0692  Gluconate 2-dehydrogenase  56.74 
 
 
324 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108341  normal  0.227497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  55.45 
 
 
325 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  54.21 
 
 
325 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  54.21 
 
 
325 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  54.21 
 
 
325 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  53.7 
 
 
322 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3708  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50.46 
 
 
327 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.971324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  53.11 
 
 
321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  53.12 
 
 
321 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  52.94 
 
 
328 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  52.63 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26910  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  53.61 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0278379  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6845  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50.47 
 
 
321 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2904  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  50.62 
 
 
322 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2571  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  51.56 
 
 
321 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24433  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1043  2-hydroxyacid dehydrogenase  48 
 
 
324 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.344903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2568  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  52.66 
 
 
320 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00217021  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3376  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  52.04 
 
 
320 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.555118  normal  0.118844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30550  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  48.77 
 
 
326 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1215  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.72 
 
 
324 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0273  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  50.16 
 
 
325 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.443724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2382  gluconate 2-dehydrogenase  51.41 
 
 
320 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54026  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0936  2-hydroxyacid dehydrogenase  48.45 
 
 
326 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0864  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.07 
 
 
324 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1485  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.21 
 
 
332 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0199  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  48.11 
 
 
330 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4462  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.45 
 
 
324 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.53 
 
 
337 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5042  gluconate 2-dehydrogenase  48.55 
 
 
320 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4585  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.45 
 
 
324 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177962  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.48 
 
 
330 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  47.48 
 
 
330 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  47.17 
 
 
320 aa  279  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4725  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.8 
 
 
320 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3413  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.2 
 
 
328 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4613  gluconate 2-dehydrogenase  47.8 
 
 
330 aa  278  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5035  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.8 
 
 
330 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.341371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4773  gluconate 2-dehydrogenase  47.48 
 
 
330 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5135  gluconate 2-dehydrogenase  47.48 
 
 
330 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.48 
 
 
330 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1261  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.52 
 
 
324 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829817  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50.36 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2000  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50.54 
 
 
318 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580581  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1736  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.47 
 
 
335 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1209  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  45.09 
 
 
325 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13500  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  45.82 
 
 
325 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  44.68 
 
 
334 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  44.89 
 
 
327 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  45 
 
 
331 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  53.75 
 
 
324 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  45.43 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1062  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.48 
 
 
329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558591  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0624  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.48 
 
 
329 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1103  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.48 
 
 
329 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  43.87 
 
 
329 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2771  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.55 
 
 
321 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  46.81 
 
 
330 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  43.79 
 
 
348 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4216  2-hydroxyacid dehydrogenase  43.87 
 
 
329 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243967  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  49.45 
 
 
340 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  48.34 
 
 
341 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.93 
 
 
332 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000514509 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  43.25 
 
 
346 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45 
 
 
326 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45 
 
 
326 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  43.25 
 
 
346 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  43.25 
 
 
329 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  43.25 
 
 
352 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  41.77 
 
 
317 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>