More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0031 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008790  CJJ81176_pTet0031  single-strand binding protein family  100 
 
 		 141 aa  292  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0139  single-strand binding protein family  47.54 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0014  hypothetical protein  43.75 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a027  single-stranded DNA binding protein  44.14 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  35.2 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  35.61 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  31.67 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  34.85 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  37.14 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  31.62 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  34 
 
 		 236 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  34 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  34 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  34 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  34 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  34 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  34 
 
 		 236 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  28.17 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  28.17 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  28.17 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 180 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  38.14 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 183 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  30.43 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  36.36 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  32.23 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  39.18 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  28.81 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  32.69 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  34.58 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  29.92 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  29.92 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  37.37 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  37.37 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  37.37 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  32.77 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  33.6 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  31.86 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  30.4 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  29.92 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  35.35 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  31.43 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  32.74 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  32.5 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  33.98 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0868  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  36.96 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  36.96 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  36.96 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  36.96 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  36.96 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  31.87 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>