More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0139 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0139  single-strand binding protein family  100 
 
 		 138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0031  single-strand binding protein family  47.54 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0014  hypothetical protein  46.02 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  48.94 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  48.94 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  41.07 
 
 		 182 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  41.07 
 
 		 182 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 183 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  47.87 
 
 		 234 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  40.18 
 
 		 175 aa  87  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  42.86 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  40.37 
 
 		 209 aa  86.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 182 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  43.14 
 
 		 180 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  41.82 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 236 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 196 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 235 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  43.69 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  43.69 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  43.69 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  43.69 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  43.69 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  46.32 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  42.99 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  41.07 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  43.62 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  37.4 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  42.72 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  46.32 
 
 		 181 aa  80.5  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 225 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  44.21 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  44.21 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 242 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  43.16 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  37.9 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  48.42 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  45.26 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  46.32 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  46.32 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  41.75 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  46.32 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  45.26 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  42.86 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  42.72 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  44.21 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  45.26 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  42.72 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  42.55 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0485  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0514  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.61 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0518  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.183562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  45.26 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  38.17 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  36.09 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  46.32 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>