More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1149 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03652  ketol-acid reductoisomerase  71.84 
 
 		 491 aa  717    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0412359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4202  ketol-acid reductoisomerase  71.84 
 
 		 491 aa  717    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5208  ketol-acid reductoisomerase  71.43 
 
 		 491 aa  716    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4134  ketol-acid reductoisomerase  70.82 
 
 		 491 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4191  ketol-acid reductoisomerase  70.82 
 
 		 491 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4839  ketol-acid reductoisomerase  68.9 
 
 		 493 aa  711    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4349  ketol-acid reductoisomerase  70.67 
 
 		 492 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2860  ketol-acid reductoisomerase  80.61 
 
 		 489 aa  832    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.673164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3935  ketol-acid reductoisomerase  69.98 
 
 		 492 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0087  ketol-acid reductoisomerase  72.51 
 
 		 494 aa  751    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00478  ketol-acid reductoisomerase  73.32 
 
 		 514 aa  759    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2758  ketol-acid reductoisomerase  74.23 
 
 		 490 aa  763    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2550  ketol-acid reductoisomerase  73.93 
 
 		 494 aa  759    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.393335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4009  ketol-acid reductoisomerase  71.84 
 
 		 491 aa  722    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2518  ketol-acid reductoisomerase  74.49 
 
 		 490 aa  757    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0441  ketol-acid reductoisomerase  69.86 
 
 		 493 aa  731    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4166  ketol-acid reductoisomerase  69.25 
 
 		 493 aa  725    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4228  ketol-acid reductoisomerase  71.84 
 
 		 491 aa  717    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4285  ketol-acid reductoisomerase  71.63 
 
 		 491 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3422  ketol-acid reductoisomerase  83.27 
 
 		 493 aa  860    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000227916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4240  ketol-acid reductoisomerase  70.82 
 
 		 491 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0493  ketol-acid reductoisomerase  70.26 
 
 		 492 aa  703    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.195058  normal  0.0261398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0163  ketol-acid reductoisomerase  70.47 
 
 		 492 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4129  ketol-acid reductoisomerase  69.78 
 
 		 492 aa  736    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3846  ketol-acid reductoisomerase  78.21 
 
 		 490 aa  806    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30642  decreased coverage  0.000000000809621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3615  ketol-acid reductoisomerase  69.86 
 
 		 492 aa  735    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0146  ketol-acid reductoisomerase  70.67 
 
 		 492 aa  706    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4021  ketol-acid reductoisomerase  71.28 
 
 		 492 aa  706    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3990  ketol-acid reductoisomerase  71.84 
 
 		 491 aa  717    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0344  ketol-acid reductoisomerase  68.64 
 
 		 493 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4146  ketol-acid reductoisomerase  71.43 
 
 		 491 aa  715    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.683953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3415  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 		 492 aa  706    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4010  ketol-acid reductoisomerase  70.18 
 
 		 492 aa  737    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0288  ketol-acid reductoisomerase  69.86 
 
 		 493 aa  725    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4255  ketol-acid reductoisomerase  70.93 
 
 		 494 aa  731    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1483  ketol-acid reductoisomerase  74.03 
 
 		 490 aa  764    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1149  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 492 aa  1020    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0733267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1671  ketol-acid reductoisomerase  68.22 
 
 		 493 aa  695    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0361  ketol-acid reductoisomerase  69.86 
 
 		 492 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3665  ketol-acid reductoisomerase  70.06 
 
 		 492 aa  740    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0421  ketol-acid reductoisomerase  69.04 
 
 		 493 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4213  ketol-acid reductoisomerase  71.08 
 
 		 492 aa  703    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4751  ketol-acid reductoisomerase  70.82 
 
 		 491 aa  704    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001983  ketol-acid reductoisomerase  73.52 
 
 		 494 aa  763    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4119  ketol-acid reductoisomerase  71.02 
 
 		 491 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4032  ketol-acid reductoisomerase  69.98 
 
 		 492 aa  736    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0355  ketol-acid reductoisomerase  69.86 
 
 		 492 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4051  ketol-acid reductoisomerase  70.47 
 
 		 492 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03601  hypothetical protein  71.84 
 
 		 491 aa  717    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357952  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4299  ketol-acid reductoisomerase  71.02 
 
 		 491 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3282  ketol-acid reductoisomerase  68.78 
 
 		 493 aa  711    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04021  ketol-acid reductoisomerase  72.15 
 
 		 492 aa  747    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0853  ketol-acid reductoisomerase  76.63 
 
 		 493 aa  797    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3768  ketol-acid reductoisomerase  70.26 
 
 		 492 aa  702    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4140  ketol-acid reductoisomerase  71.63 
 
 		 491 aa  717    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0447832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  37.03 
 
 		 359 aa  183  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  37.75 
 
 		 338 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  39.07 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  35.94 
 
 		 331 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  37.05 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  34.49 
 
 		 338 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  35.44 
 
 		 331 aa  174  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  35.76 
 
 		 338 aa  173  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1178  ketol-acid reductoisomerase  36.19 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  35.96 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2218  ketol-acid reductoisomerase  38.49 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  34.38 
 
 		 338 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  34.52 
 
 		 338 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  34.38 
 
 		 338 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  32.91 
 
 		 338 aa  171  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  32.91 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  34.18 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  35.44 
 
 		 338 aa  170  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  35.33 
 
 		 330 aa  170  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  32.18 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  34.07 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  35.23 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  38.18 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  35.79 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  36.88 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  34.67 
 
 		 330 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  38.18 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  33.22 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  33.22 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  36.08 
 
 		 338 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  37.84 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  34.18 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 		 338 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  33.22 
 
 		 338 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  37.84 
 
 		 339 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  34.06 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  34.53 
 
 		 338 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  33.88 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  35.13 
 
 		 330 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  33.44 
 
 		 330 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  33.86 
 
 		 338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  37.84 
 
 		 339 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  31.65 
 
 		 338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  32.92 
 
 		 338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  34.49 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>