More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00478 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03652  ketol-acid reductoisomerase  75.3 
 
 		 491 aa  762    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0412359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4202  ketol-acid reductoisomerase  75.3 
 
 		 491 aa  762    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1483  ketol-acid reductoisomerase  71.72 
 
 		 490 aa  727    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0344  ketol-acid reductoisomerase  71.43 
 
 		 493 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4839  ketol-acid reductoisomerase  72.1 
 
 		 493 aa  746    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4010  ketol-acid reductoisomerase  72.04 
 
 		 492 aa  758    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4349  ketol-acid reductoisomerase  72.65 
 
 		 492 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0146  ketol-acid reductoisomerase  77.94 
 
 		 492 aa  794    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4299  ketol-acid reductoisomerase  75.51 
 
 		 491 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3990  ketol-acid reductoisomerase  75.3 
 
 		 491 aa  762    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4129  ketol-acid reductoisomerase  71.63 
 
 		 492 aa  757    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001983  ketol-acid reductoisomerase  98.38 
 
 		 494 aa  1014    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3422  ketol-acid reductoisomerase  71.89 
 
 		 493 aa  725    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000227916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0441  ketol-acid reductoisomerase  72.24 
 
 		 493 aa  756    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5208  ketol-acid reductoisomerase  75.51 
 
 		 491 aa  762    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4140  ketol-acid reductoisomerase  75.71 
 
 		 491 aa  763    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0447832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2518  ketol-acid reductoisomerase  71.52 
 
 		 490 aa  729    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4166  ketol-acid reductoisomerase  72.24 
 
 		 493 aa  757    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3768  ketol-acid reductoisomerase  76.92 
 
 		 492 aa  786    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4134  ketol-acid reductoisomerase  75.51 
 
 		 491 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0087  ketol-acid reductoisomerase  91.5 
 
 		 494 aa  962    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4146  ketol-acid reductoisomerase  75.71 
 
 		 491 aa  763    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.683953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0163  ketol-acid reductoisomerase  77.94 
 
 		 492 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4021  ketol-acid reductoisomerase  77.73 
 
 		 492 aa  791    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2758  ketol-acid reductoisomerase  71.52 
 
 		 490 aa  728    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00478  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 514 aa  1068    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3846  ketol-acid reductoisomerase  74.49 
 
 		 490 aa  771    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30642  decreased coverage  0.000000000809621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3615  ketol-acid reductoisomerase  72.24 
 
 		 492 aa  763    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3935  ketol-acid reductoisomerase  71.63 
 
 		 492 aa  757    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2550  ketol-acid reductoisomerase  91.68 
 
 		 494 aa  956    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.393335  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3415  ketol-acid reductoisomerase  72.1 
 
 		 492 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4285  ketol-acid reductoisomerase  75.71 
 
 		 491 aa  763    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4255  ketol-acid reductoisomerase  74.9 
 
 		 494 aa  793    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1149  ketol-acid reductoisomerase  73.32 
 
 		 492 aa  759    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0733267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1671  ketol-acid reductoisomerase  74.55 
 
 		 493 aa  759    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2860  ketol-acid reductoisomerase  72.86 
 
 		 489 aa  746    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.673164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0361  ketol-acid reductoisomerase  72.45 
 
 		 492 aa  764    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3665  ketol-acid reductoisomerase  72.45 
 
 		 492 aa  763    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0421  ketol-acid reductoisomerase  71.84 
 
 		 493 aa  750    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4191  ketol-acid reductoisomerase  75.51 
 
 		 491 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04021  ketol-acid reductoisomerase  75.61 
 
 		 492 aa  796    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4213  ketol-acid reductoisomerase  77.33 
 
 		 492 aa  785    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4240  ketol-acid reductoisomerase  75.91 
 
 		 491 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4119  ketol-acid reductoisomerase  75.51 
 
 		 491 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0288  ketol-acid reductoisomerase  72.45 
 
 		 493 aa  761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0493  ketol-acid reductoisomerase  77.73 
 
 		 492 aa  789    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.195058  normal  0.0261398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0355  ketol-acid reductoisomerase  72.45 
 
 		 492 aa  764    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4032  ketol-acid reductoisomerase  71.84 
 
 		 492 aa  758    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4051  ketol-acid reductoisomerase  77.94 
 
 		 492 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4751  ketol-acid reductoisomerase  77.94 
 
 		 491 aa  786    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3282  ketol-acid reductoisomerase  72.91 
 
 		 493 aa  763    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4009  ketol-acid reductoisomerase  75.71 
 
 		 491 aa  768    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0853  ketol-acid reductoisomerase  74.08 
 
 		 493 aa  771    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4228  ketol-acid reductoisomerase  75.3 
 
 		 491 aa  762    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03601  hypothetical protein  75.3 
 
 		 491 aa  762    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  34.74 
 
 		 359 aa  183  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  37.58 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  36.88 
 
 		 339 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  38.28 
 
 		 338 aa  170  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  36.5 
 
 		 339 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  37.72 
 
 		 338 aa  170  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  36.73 
 
 		 339 aa  170  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  34.65 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  37.5 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  35.31 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  34.65 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  36.5 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  35.62 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  34.65 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  35.61 
 
 		 339 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  34.74 
 
 		 339 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  37.29 
 
 		 339 aa  167  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  37.29 
 
 		 339 aa  167  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  34.62 
 
 		 338 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  37.72 
 
 		 338 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  34.97 
 
 		 339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  36.99 
 
 		 339 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2857  ketol-acid reductoisomerase  36.88 
 
 		 339 aa  166  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  36.31 
 
 		 339 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  36.33 
 
 		 338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  36.81 
 
 		 339 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  37.29 
 
 		 339 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  35.29 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  34.81 
 
 		 338 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  34.35 
 
 		 338 aa  163  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  34.64 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  35.44 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  35.42 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  34.42 
 
 		 347 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  34.78 
 
 		 338 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1178  ketol-acid reductoisomerase  35.53 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  36.31 
 
 		 346 aa  160  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  33.87 
 
 		 339 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  34.25 
 
 		 339 aa  160  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  35.49 
 
 		 338 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  33.45 
 
 		 338 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  33.68 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  36.08 
 
 		 339 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  34.15 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>