More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4255 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03652  ketol-acid reductoisomerase  71.81 
 
 		 491 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0412359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4202  ketol-acid reductoisomerase  71.81 
 
 		 491 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4119  ketol-acid reductoisomerase  71.4 
 
 		 491 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0344  ketol-acid reductoisomerase  73.78 
 
 		 493 aa  761    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00478  ketol-acid reductoisomerase  74.9 
 
 		 514 aa  793    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4839  ketol-acid reductoisomerase  71.81 
 
 		 493 aa  749    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4009  ketol-acid reductoisomerase  72.01 
 
 		 491 aa  730    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4349  ketol-acid reductoisomerase  75.05 
 
 		 492 aa  774    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4240  ketol-acid reductoisomerase  71.81 
 
 		 491 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03601  hypothetical protein  71.81 
 
 		 491 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4032  ketol-acid reductoisomerase  73.83 
 
 		 492 aa  768    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0493  ketol-acid reductoisomerase  72.62 
 
 		 492 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.195058  normal  0.0261398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001983  ketol-acid reductoisomerase  75.1 
 
 		 494 aa  796    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1483  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 490 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4021  ketol-acid reductoisomerase  74.04 
 
 		 492 aa  748    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3422  ketol-acid reductoisomerase  68.42 
 
 		 493 aa  706    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000227916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4285  ketol-acid reductoisomerase  71.81 
 
 		 491 aa  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0087  ketol-acid reductoisomerase  74.08 
 
 		 494 aa  782    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04021  ketol-acid reductoisomerase  85.74 
 
 		 492 aa  897    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3615  ketol-acid reductoisomerase  73.83 
 
 		 492 aa  766    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2518  ketol-acid reductoisomerase  69.73 
 
 		 490 aa  713    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5208  ketol-acid reductoisomerase  71.6 
 
 		 491 aa  719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4051  ketol-acid reductoisomerase  72.82 
 
 		 492 aa  737    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3935  ketol-acid reductoisomerase  73.63 
 
 		 492 aa  768    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4299  ketol-acid reductoisomerase  71.6 
 
 		 491 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3990  ketol-acid reductoisomerase  71.81 
 
 		 491 aa  719    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4129  ketol-acid reductoisomerase  73.63 
 
 		 492 aa  767    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3846  ketol-acid reductoisomerase  68.84 
 
 		 490 aa  717    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30642  decreased coverage  0.000000000809621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4213  ketol-acid reductoisomerase  73.83 
 
 		 492 aa  746    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0288  ketol-acid reductoisomerase  73.17 
 
 		 493 aa  756    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3415  ketol-acid reductoisomerase  73.17 
 
 		 492 aa  749    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0146  ketol-acid reductoisomerase  74.24 
 
 		 492 aa  752    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4255  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 494 aa  1021    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2758  ketol-acid reductoisomerase  69.94 
 
 		 490 aa  714    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302055  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1149  ketol-acid reductoisomerase  70.93 
 
 		 492 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0733267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1671  ketol-acid reductoisomerase  73.73 
 
 		 493 aa  741    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4010  ketol-acid reductoisomerase  74.04 
 
 		 492 aa  768    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0361  ketol-acid reductoisomerase  73.63 
 
 		 492 aa  764    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3665  ketol-acid reductoisomerase  73.63 
 
 		 492 aa  763    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0421  ketol-acid reductoisomerase  72.82 
 
 		 493 aa  750    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4191  ketol-acid reductoisomerase  71.4 
 
 		 491 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4134  ketol-acid reductoisomerase  71.23 
 
 		 491 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4140  ketol-acid reductoisomerase  71.81 
 
 		 491 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0447832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3768  ketol-acid reductoisomerase  73.83 
 
 		 492 aa  745    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4228  ketol-acid reductoisomerase  71.81 
 
 		 491 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4751  ketol-acid reductoisomerase  73.02 
 
 		 491 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4166  ketol-acid reductoisomerase  72.97 
 
 		 493 aa  763    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0355  ketol-acid reductoisomerase  73.63 
 
 		 492 aa  763    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0441  ketol-acid reductoisomerase  73.58 
 
 		 493 aa  766    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4146  ketol-acid reductoisomerase  71.81 
 
 		 491 aa  718    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.683953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2860  ketol-acid reductoisomerase  70.61 
 
 		 489 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.673164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3282  ketol-acid reductoisomerase  73.83 
 
 		 493 aa  766    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2550  ketol-acid reductoisomerase  74.49 
 
 		 494 aa  787    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.393335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0853  ketol-acid reductoisomerase  73.43 
 
 		 493 aa  773    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0163  ketol-acid reductoisomerase  72.82 
 
 		 492 aa  737    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  36.16 
 
 		 359 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  38.87 
 
 		 338 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  39.29 
 
 		 338 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  38.11 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  36.84 
 
 		 338 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  37.5 
 
 		 338 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1178  ketol-acid reductoisomerase  36.39 
 
 		 326 aa  174  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  35.62 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  38.57 
 
 		 339 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  34.16 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  38.36 
 
 		 339 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  33.87 
 
 		 338 aa  170  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  37.33 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  37.25 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  34.63 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  34.19 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  38.23 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  37.25 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  34.54 
 
 		 338 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  37.67 
 
 		 339 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  34.54 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  35.53 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  37.2 
 
 		 339 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  32.8 
 
 		 338 aa  167  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  35.28 
 
 		 340 aa  166  9e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  36.99 
 
 		 339 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  36.99 
 
 		 339 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  32.67 
 
 		 338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  32.4 
 
 		 347 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  35.83 
 
 		 338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  34.64 
 
 		 343 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  36.55 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  35.96 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  36.15 
 
 		 339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  35.46 
 
 		 331 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  36.55 
 
 		 330 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  34.59 
 
 		 330 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  34.48 
 
 		 338 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  38.8 
 
 		 338 aa  163  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  32.69 
 
 		 338 aa  163  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  37.73 
 
 		 346 aa  163  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  33.87 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  36.61 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  31.15 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  36.3 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>