More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04200 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04200  putative hemolysin  100 
 
 
429 aa  849    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.545831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1414  hypothetical protein  61.46 
 
 
419 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1275  protein of unknown function DUF21  61.23 
 
 
435 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0451  CBS domain-containing protein  39.33 
 
 
417 aa  317  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.247844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1017  CBS domain containing protein  36.67 
 
 
421 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1440  transporter-associated region  35.05 
 
 
427 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.252148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2686  transporter-associated region  44.34 
 
 
400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  31.02 
 
 
420 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0095  CBS domain containing protein  29.59 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  28.51 
 
 
420 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  30 
 
 
422 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.86 
 
 
425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  29.38 
 
 
425 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  28.44 
 
 
426 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  28.44 
 
 
447 aa  156  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.84 
 
 
438 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  29.48 
 
 
431 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  27.79 
 
 
436 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  28.71 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  29.04 
 
 
444 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  27.54 
 
 
436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  25.12 
 
 
477 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  29.18 
 
 
418 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30.02 
 
 
420 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  25.59 
 
 
440 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  27.74 
 
 
417 aa  151  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  24.59 
 
 
424 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  24.31 
 
 
428 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  25.93 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  24.64 
 
 
434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  27.57 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  26.56 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  25.72 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  25.36 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  28.33 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  27.83 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  24.62 
 
 
464 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  27.53 
 
 
431 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  25.63 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  26.73 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  26.5 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  28.77 
 
 
421 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0912  hypothetical protein  26.82 
 
 
412 aa  146  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  25.78 
 
 
464 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  25.44 
 
 
435 aa  146  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  25.49 
 
 
464 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  27.04 
 
 
465 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  27.15 
 
 
467 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  27.55 
 
 
431 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.46 
 
 
430 aa  145  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  27.66 
 
 
444 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  27.11 
 
 
434 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  28.44 
 
 
445 aa  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0847  hypothetical protein  24.71 
 
 
440 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  hitchhiker  0.000695829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  29.33 
 
 
443 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  27.01 
 
 
414 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  29.93 
 
 
455 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  27.66 
 
 
434 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  25.64 
 
 
413 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  25.12 
 
 
441 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  24.12 
 
 
424 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  27.15 
 
 
476 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  29.98 
 
 
455 aa  143  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  27.16 
 
 
443 aa  143  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0204  putative hemolysin  29.7 
 
 
412 aa  143  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  29.31 
 
 
423 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  24.59 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  26.5 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  29.26 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  27.38 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  27.38 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  27.93 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  27.19 
 
 
445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  27.39 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  28.13 
 
 
423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
447 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
433 aa  139  7e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  24.88 
 
 
413 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  24.88 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  24.88 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  24.88 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  24.41 
 
 
413 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  24.41 
 
 
413 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  26.33 
 
 
422 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  28.01 
 
 
436 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  24.88 
 
 
413 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  24.88 
 
 
461 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  25.88 
 
 
420 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  26.22 
 
 
468 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  27.19 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  33.68 
 
 
435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  24.59 
 
 
420 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  24.59 
 
 
420 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  27.76 
 
 
436 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  28.29 
 
 
439 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  24.59 
 
 
420 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  24.59 
 
 
420 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  29.75 
 
 
440 aa  137  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  25.81 
 
 
425 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  25.12 
 
 
429 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>