More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1275 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1275  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 435 aa  874    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04200  putative hemolysin  61.41 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.545831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1414  hypothetical protein  60.49 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0451  CBS domain-containing protein  42.01 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.247844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1440  transporter-associated region  37.41 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.252148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1017  CBS domain containing protein  38.33 
 
 		 421 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2686  transporter-associated region  40.68 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0095  CBS domain containing protein  30.71 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.53 
 
 		 420 aa  192  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  30.62 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.83 
 
 		 422 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  30.88 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  32.22 
 
 		 420 aa  176  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  28.89 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.85 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.78 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  31.47 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  29.34 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  29.65 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  27.84 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  29.85 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  29.14 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  26.62 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  32.23 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  27.15 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0912  hypothetical protein  29.4 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  26.88 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  29.21 
 
 		 434 aa  163  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  29.18 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  28.84 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  26.7 
 
 		 418 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  27.92 
 
 		 456 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  26.56 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  29.87 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  29.17 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  29.63 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  26.68 
 
 		 464 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  27.78 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  27.11 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  27.99 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.14 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  27.48 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  28.91 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  27.62 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  28.94 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  29.29 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  30.07 
 
 		 422 aa  156  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  31.77 
 
 		 424 aa  156  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  24.94 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  24.94 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  27.56 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  27.25 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  29.09 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  28.29 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  27.66 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  26.44 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  29.08 
 
 		 447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  27.78 
 
 		 448 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  27.79 
 
 		 429 aa  152  8e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  26.94 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  26.94 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  27.4 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  28.44 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.32 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2102  hypothetical protein  27.96 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0719505  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  28.14 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0376  CBS domain containing protein  28.4 
 
 		 404 aa  151  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  26.71 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  27.5 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  25 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  26.39 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  29.88 
 
 		 455 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 		 444 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  26.82 
 
 		 442 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  27.23 
 
 		 429 aa  149  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  26.71 
 
 		 442 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  25.57 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  26.59 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  26.61 
 
 		 443 aa  149  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  26.59 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4712  hypothetical protein  25.84 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  23.67 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  25.33 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  29.86 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  26.85 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  26.63 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  26.53 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  26.65 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  26.2 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  26.79 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  26.13 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  26.38 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  26.38 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  26 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  27.36 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  26.15 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  26.14 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  24.47 
 
 		 447 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  26.5 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>