More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2686 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2686  transporter-associated region  100 
 
 		 400 aa  815    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1440  transporter-associated region  59.01 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.252148 
 
 
-
 
NC_002950  PG0451  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.247844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04200  putative hemolysin  44.34 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.545831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1017  CBS domain containing protein  44.49 
 
 		 421 aa  215  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1275  protein of unknown function DUF21  40.68 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0095  CBS domain containing protein  42.42 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1414  hypothetical protein  36.84 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  32.49 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.75 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.2 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.19 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  32.88 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  27.74 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  33.04 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  34.04 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 		 291 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  34.06 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  34.06 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  34.06 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  34.06 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0912  hypothetical protein  32.07 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.62 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  32.02 
 
 		 443 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  35.04 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  29.24 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  32.13 
 
 		 279 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  32.91 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.53 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  33.04 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  32.31 
 
 		 323 aa  137  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  30.99 
 
 		 284 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  31.08 
 
 		 273 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  31.88 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  33.48 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  31.53 
 
 		 292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  32.88 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  32.78 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  32.31 
 
 		 285 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 279 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  32.58 
 
 		 279 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  31.33 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 279 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.11 
 
 		 284 aa  133  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  31.53 
 
 		 280 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  28.15 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  31.08 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  32.16 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  33.92 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01227  hypothetical protein  34.47 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  31 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0385  protein of unknown function DUF21  32.07 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  29.92 
 
 		 285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  33.47 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  25.36 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  34.78 
 
 		 433 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  24.69 
 
 		 420 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  31.47 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  33.03 
 
 		 425 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  32.2 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  32.91 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  32.48 
 
 		 523 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  27.32 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  32.35 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  30.36 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  30 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  25 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  31.39 
 
 		 285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 		 250 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  28.75 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  33.62 
 
 		 297 aa  126  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  30.04 
 
 		 279 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  32.16 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  31.86 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  31 
 
 		 293 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  33.47 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1671  CBS domain containing protein  33.05 
 
 		 273 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152049  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  33.64 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  29.83 
 
 		 287 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  31.86 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  30.69 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  27 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  30.43 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  32.43 
 
 		 281 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  31.7 
 
 		 285 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  25.22 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>