More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1440 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1440  transporter-associated region  100 
 
 
427 aa  863    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.252148 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1275  protein of unknown function DUF21  37.94 
 
 
435 aa  299  6e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2686  transporter-associated region  40.14 
 
 
400 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04200  putative hemolysin  35.12 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.545831  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0451  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 
417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.247844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1017  CBS domain containing protein  36.27 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1414  hypothetical protein  34.47 
 
 
419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0095  CBS domain containing protein  33.97 
 
 
416 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.08 
 
 
430 aa  188  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  29.15 
 
 
443 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  30.35 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  27.94 
 
 
477 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  28.94 
 
 
434 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  28.03 
 
 
446 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  29.1 
 
 
425 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  26.9 
 
 
437 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  29.05 
 
 
437 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  27.73 
 
 
420 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  30.48 
 
 
465 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.24 
 
 
422 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.89 
 
 
438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.16 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0912  hypothetical protein  27.46 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  28.18 
 
 
476 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  29.2 
 
 
434 aa  162  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  30.62 
 
 
439 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  29.64 
 
 
437 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  28.48 
 
 
455 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  28.24 
 
 
441 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  27.03 
 
 
447 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  28.19 
 
 
437 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  29.72 
 
 
479 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  27.42 
 
 
429 aa  159  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  28.03 
 
 
442 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  27.13 
 
 
440 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 
442 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  28.57 
 
 
430 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 
439 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  28.9 
 
 
452 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  27.8 
 
 
442 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  27.8 
 
 
442 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  25.36 
 
 
428 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  28.54 
 
 
455 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  27.17 
 
 
431 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  27.51 
 
 
437 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  28.03 
 
 
442 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  27.58 
 
 
442 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  27.52 
 
 
440 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  28.9 
 
 
443 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  27.58 
 
 
442 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  28.51 
 
 
454 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  27.58 
 
 
442 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  28.18 
 
 
421 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  26.02 
 
 
432 aa  156  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  26.48 
 
 
463 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 
434 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  27.67 
 
 
431 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  26.48 
 
 
463 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  27.1 
 
 
429 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  28.74 
 
 
442 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  28.07 
 
 
455 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  28.18 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  27.4 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  27.95 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  27.64 
 
 
443 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  27.64 
 
 
443 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  26.27 
 
 
422 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  27.66 
 
 
446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  28.19 
 
 
447 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.18 
 
 
417 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  26.37 
 
 
445 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  26.91 
 
 
436 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  26.23 
 
 
440 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  28.27 
 
 
434 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.94 
 
 
424 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  27.39 
 
 
442 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  28.4 
 
 
435 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  27.29 
 
 
417 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0385  protein of unknown function DUF21  27.17 
 
 
434 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237967  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  26.32 
 
 
417 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  26.87 
 
 
447 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  27.05 
 
 
523 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  27.71 
 
 
424 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  26.87 
 
 
423 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  27.19 
 
 
453 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  26.35 
 
 
414 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  26.27 
 
 
457 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  27.34 
 
 
418 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  26.75 
 
 
428 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  26.74 
 
 
438 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  26.16 
 
 
426 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  26.9 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  24.94 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  27.06 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  27.62 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  26.78 
 
 
574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  28.25 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  27.64 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  25.48 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  25.3 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>