More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1954 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1108    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  72.89 
 
 
503 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  61.1 
 
 
450 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  52.63 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  45.21 
 
 
490 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  50.69 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  52.93 
 
 
451 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  50.85 
 
 
443 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  55.83 
 
 
453 aa  385  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  50.34 
 
 
444 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  49.14 
 
 
486 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  52.09 
 
 
439 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  52.93 
 
 
451 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  48.91 
 
 
445 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  49.32 
 
 
443 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  47.59 
 
 
457 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  46.9 
 
 
452 aa  362  8e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  47.76 
 
 
451 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  47.29 
 
 
471 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  47.29 
 
 
471 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  47.29 
 
 
470 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  45.83 
 
 
461 aa  353  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  45.73 
 
 
438 aa  348  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  47.33 
 
 
450 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  47.94 
 
 
438 aa  344  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  48.99 
 
 
474 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  45.68 
 
 
455 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  47.15 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  45.35 
 
 
453 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  44.65 
 
 
452 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  42.72 
 
 
520 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  43 
 
 
452 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  43.25 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  40.7 
 
 
441 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  38.06 
 
 
451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  36.3 
 
 
446 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  37.03 
 
 
446 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  38.31 
 
 
458 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  42.16 
 
 
486 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  38.06 
 
 
458 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  38.06 
 
 
458 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  39.26 
 
 
451 aa  256  7e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  38.18 
 
 
462 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  37.35 
 
 
460 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  38.35 
 
 
455 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  35.27 
 
 
431 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.23 
 
 
442 aa  237  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.97 
 
 
437 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  36.6 
 
 
440 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  31.15 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  37 
 
 
496 aa  232  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  36.76 
 
 
459 aa  230  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  36.54 
 
 
453 aa  231  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  36.47 
 
 
443 aa  229  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  32.6 
 
 
456 aa  229  9e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  34.79 
 
 
443 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  40.84 
 
 
468 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  37 
 
 
464 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  31 
 
 
435 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.28 
 
 
435 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 
443 aa  226  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  31.44 
 
 
435 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  31.44 
 
 
435 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  31.44 
 
 
435 aa  225  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  37.1 
 
 
451 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  34.81 
 
 
442 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.76 
 
 
442 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  31.44 
 
 
435 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  33.12 
 
 
477 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
435 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
435 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  34.21 
 
 
439 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.41 
 
 
446 aa  221  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.44 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  29.49 
 
 
434 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  33.64 
 
 
438 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
435 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  37.32 
 
 
440 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  33.9 
 
 
431 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  31.58 
 
 
435 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  35.66 
 
 
469 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.43 
 
 
428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  29.51 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  36.18 
 
 
456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  33.94 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.92 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  32.14 
 
 
463 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  32.14 
 
 
463 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  33.33 
 
 
443 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 
478 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  34.08 
 
 
450 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  29.52 
 
 
443 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  29.52 
 
 
443 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
433 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  30.14 
 
 
430 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  33.57 
 
 
434 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  29.86 
 
 
428 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  33.26 
 
 
436 aa  206  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  29.44 
 
 
451 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  31.04 
 
 
443 aa  206  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>