More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0195 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0195  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
304 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.74 
 
 
304 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.79 
 
 
304 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.11 
 
 
305 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58779  normal  0.456296 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.89 
 
 
304 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1251  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  85.15 
 
 
304 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.49 
 
 
304 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.5 
 
 
304 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887785  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.5 
 
 
304 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0666762  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.5 
 
 
304 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.043674 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2559  putative dipeptide transport system permease protein  83.96 
 
 
313 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1309  ABC transporter, permease protein  83.96 
 
 
313 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1390  ABC transporter, permease protein  83.96 
 
 
313 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.028004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1276  ABC transporter, permease protein  83.62 
 
 
313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1444  ABC transporter, permease protein  83.96 
 
 
313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.49 
 
 
304 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165085  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0249  ABC transporter, permease protein  83.62 
 
 
313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0520  ABC transporter, permease protein  83.62 
 
 
313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.747108  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1048  ABC transporter, permease protein  83.62 
 
 
313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  63.95 
 
 
300 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.95 
 
 
300 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.05 
 
 
301 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.07 
 
 
319 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.86 
 
 
305 aa  360  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.09 
 
 
310 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.373123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3886  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  63.05 
 
 
301 aa  357  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.59 
 
 
300 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.6 
 
 
300 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.46 
 
 
311 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.79 
 
 
311 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428406  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.55 
 
 
301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.89 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.82 
 
 
300 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.9 
 
 
308 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.26 
 
 
301 aa  332  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.63 
 
 
310 aa  332  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1919  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.71 
 
 
310 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.307176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  58.82 
 
 
301 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.44 
 
 
300 aa  328  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.68 
 
 
307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.43 
 
 
298 aa  325  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.193699  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.5 
 
 
310 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57 
 
 
307 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.53 
 
 
300 aa  321  8e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.68 
 
 
304 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.637669  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.41 
 
 
311 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.23044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.59 
 
 
296 aa  309  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.232197  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1028  dipeptide ABC transporter, permease protein  55.59 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.29309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 
300 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397277  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.36 
 
 
300 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44403  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.19 
 
 
277 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.28 
 
 
289 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.89 
 
 
291 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.36 
 
 
290 aa  279  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3553  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease protein  54.58 
 
 
278 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4038  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  54.58 
 
 
278 aa  278  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.58 
 
 
278 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  46.1 
 
 
301 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.71 
 
 
286 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  47.77 
 
 
300 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.92 
 
 
285 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.77 
 
 
300 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.48 
 
 
301 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388501  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  47.24 
 
 
300 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.38 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
300 aa  252  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.94 
 
 
295 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
302 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
299 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
280 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
299 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
308 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
287 aa  245  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 
302 aa  245  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  46.55 
 
 
304 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.81 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1080  peptide ABC transporter, permease protein  49.22 
 
 
281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0826305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.76 
 
 
280 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  42.28 
 
 
299 aa  242  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  42.28 
 
 
299 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  42.28 
 
 
299 aa  242  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  44.73 
 
 
302 aa  242  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  42.28 
 
 
299 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  42.28 
 
 
299 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 
296 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
304 aa  239  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
308 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.82 
 
 
304 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 
296 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
308 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.68 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.27 
 
 
302 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.82 
 
 
308 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  45.15 
 
 
284 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
303 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  47.27 
 
 
303 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  44.22 
 
 
298 aa  235  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.45 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.09 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  43.73 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>