More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3897 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3897  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
91 aa  186  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.259791  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0641  heat shock protein DnaJ-like  79.12 
 
 
102 aa  146  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3253  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  87.91 
 
 
91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3228  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  68.13 
 
 
93 aa  133  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.862412  normal  0.903575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3636  heat shock protein DnaJ, N-terminal  47.73 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00302094  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0797  heat shock protein DnaJ domain protein  53.85 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.95295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  47.3 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 
392 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 
392 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  47.3 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 
392 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1647  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51193  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
370 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
361 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 
385 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
375 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
373 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
396 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  50.77 
 
 
359 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.52 
 
 
393 aa  67.8  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
370 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  52.38 
 
 
302 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  46.88 
 
 
375 aa  67.4  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
377 aa  67.4  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  52.38 
 
 
377 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  47.69 
 
 
355 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  48.39 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10330  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0686048  unclonable  0.00000000184085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  48.39 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0006  chaperone protein DnaJ  47.69 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359061  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  40.66 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  53.85 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  48.48 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 
395 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
356 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.79 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
385 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
385 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  51.56 
 
 
372 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 
398 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 
385 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
375 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  50 
 
 
396 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9681  predicted protein  51.67 
 
 
60 aa  63.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0488  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 
400 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
374 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
377 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
372 aa  63.5  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
378 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  50.79 
 
 
298 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
383 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  52.38 
 
 
326 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  46.03 
 
 
380 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  47.62 
 
 
381 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  52.24 
 
 
406 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.44 
 
 
302 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  47.69 
 
 
378 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  48.39 
 
 
313 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
380 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
376 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
381 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 
381 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
396 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.66 
 
 
319 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  49.21 
 
 
382 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  50.79 
 
 
339 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.62 
 
 
334 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 
387 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  53.12 
 
 
294 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  51.52 
 
 
325 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1339  DnaJ domain-containing protein  38.55 
 
 
86 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02040  DNAj protein, putative  46.77 
 
 
503 aa  62.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
388 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1265  chaperone DnaJ  48.39 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0905779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
377 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
380 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0451  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
371 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.240923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  50.79 
 
 
337 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
374 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
377 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  52.38 
 
 
334 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  43.55 
 
 
341 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
377 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9321  predicted protein  46.77 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  46.88 
 
 
380 aa  61.6  0.000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  38.55 
 
 
384 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  50 
 
 
376 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>