More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3253 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3253  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
91 aa  186  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3897  heat shock protein DnaJ-like  87.91 
 
 
91 aa  161  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.259791  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0641  heat shock protein DnaJ-like  79.12 
 
 
102 aa  148  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3228  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  71.43 
 
 
93 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.862412  normal  0.903575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3636  heat shock protein DnaJ, N-terminal  48.89 
 
 
92 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00302094  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  48.57 
 
 
377 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0797  heat shock protein DnaJ domain protein  49.23 
 
 
369 aa  72  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.95295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
392 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
392 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
392 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  45.95 
 
 
375 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
373 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  40.96 
 
 
384 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  45.95 
 
 
375 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  50.79 
 
 
377 aa  70.1  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  40.66 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1647  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51193  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
370 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
382 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
382 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
382 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  46.97 
 
 
361 aa  68.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  51.56 
 
 
376 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
385 aa  67.8  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85654  yeast dnaJ homolog (nuclear envelope protein) heat shock protein  44.44 
 
 
404 aa  67.8  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351399  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
382 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
359 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
375 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  46.77 
 
 
356 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.62 
 
 
313 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  50 
 
 
372 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  50.79 
 
 
326 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
297 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  45.16 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  47.62 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9321  predicted protein  48.39 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  46.77 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  45.16 
 
 
369 aa  65.9  0.0000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
388 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  46.77 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  46.88 
 
 
375 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  49.23 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  46.27 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
381 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10330  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
375 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0686048  unclonable  0.00000000184085 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  45.16 
 
 
341 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  50 
 
 
396 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  45.16 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12398  chaperone protein DnaJ  44.74 
 
 
382 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000162557  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17290  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  48.39 
 
 
375 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
385 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 
374 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 
383 aa  64.7  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  46.67 
 
 
296 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  47.62 
 
 
340 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  50.79 
 
 
333 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
371 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  49.21 
 
 
382 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 
395 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
383 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  45.45 
 
 
320 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
368 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.03 
 
 
334 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
380 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
380 aa  63.9  0.0000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
377 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  45 
 
 
295 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
380 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
386 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 
396 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  45 
 
 
298 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  49.21 
 
 
337 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
366 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18036  predicted protein  48.39 
 
 
385 aa  63.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  46.03 
 
 
298 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  47.62 
 
 
375 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
385 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 
387 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
379 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>