More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0969 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0969  prephenate dehydratase  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.507901  normal  0.0127974 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.65 
 
 		 360 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.65 
 
 		 360 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.65 
 
 		 360 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.65 
 
 		 360 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.65 
 
 		 360 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.65 
 
 		 360 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.65 
 
 		 360 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.27 
 
 		 360 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  58.49 
 
 		 360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  58.87 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  56.98 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  51.88 
 
 		 371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  51.88 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  51.88 
 
 		 382 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  51.5 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  51.13 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  55.88 
 
 		 359 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  59.02 
 
 		 360 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  58.65 
 
 		 360 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  51.12 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  54.04 
 
 		 359 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  50.36 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  51.87 
 
 		 374 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  49.63 
 
 		 371 aa  254  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  49.63 
 
 		 371 aa  254  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  50 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  58.65 
 
 		 360 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  58.65 
 
 		 360 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  59.77 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  59.77 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  48.51 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  46.99 
 
 		 355 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  48.51 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  50.37 
 
 		 373 aa  244  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  48.51 
 
 		 366 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  50.93 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  58.21 
 
 		 362 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  45.72 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  42.7 
 
 		 402 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  45.11 
 
 		 365 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  43.98 
 
 		 371 aa  221  8e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.2 
 
 		 373 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  46.99 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  42.16 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  44.19 
 
 		 365 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  42.16 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  44.19 
 
 		 361 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  42.38 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  45.86 
 
 		 355 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  41.04 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.7 
 
 		 362 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  41.2 
 
 		 399 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.95 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  39.7 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  39.7 
 
 		 364 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  39.33 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.95 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  39.27 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  42.86 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  38.58 
 
 		 365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  43.54 
 
 		 373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  39.7 
 
 		 364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  39.7 
 
 		 364 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.33 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  38.95 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  40.3 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40.81 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.04 
 
 		 358 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  40.3 
 
 		 359 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  43.82 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  40.36 
 
 		 413 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.47 
 
 		 358 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.15 
 
 		 368 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.6 
 
 		 367 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  38.91 
 
 		 393 aa  188  7e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  40.23 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  37.22 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  41.28 
 
 		 706 aa  185  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  37.82 
 
 		 393 aa  185  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.59 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  41.57 
 
 		 362 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.3 
 
 		 381 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.47 
 
 		 371 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  37.22 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  37.22 
 
 		 359 aa  175  8e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.72 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  38.72 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  36.9 
 
 		 360 aa  171  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.1 
 
 		 358 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.53 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.72 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  39.33 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  35.56 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.95 
 
 		 368 aa  161  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  34.93 
 
 		 385 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  35.14 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.16 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>