40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7539 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7539  PAS sensor protein  100 
 
 		 316 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0148723 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3554  RNase II stability modulator  47.25 
 
 		 667 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4742  RNase II stability modulator  44.5 
 
 		 664 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.632651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2573  RNase II stability modulator  46.79 
 
 		 667 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3966  RNase II stability modulator  46.79 
 
 		 667 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0378593  normal  0.0378362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5122  RNase II stability modulator  45.41 
 
 		 667 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0232161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1152  RNase II stability modulator  48.84 
 
 		 667 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.584939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3462  RNase II stability modulator  45.58 
 
 		 667 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5285  RNase II stability modulator  44.95 
 
 		 667 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5454  RNase II stability modulator  48.84 
 
 		 689 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2181  RNase II stability modulator  43.06 
 
 		 663 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5279  RNase II stability modulator  44.7 
 
 		 666 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164085  normal  0.0978812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.65 
 
 		 661 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1489  RNase II stability modulator  39.65 
 
 		 661 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0536587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1517  RNase II stability modulator  39.65 
 
 		 661 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01273  hypothetical protein  38.77 
 
 		 661 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01262  modulator of Rnase II stability  38.77 
 
 		 661 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1398  RNase II stability modulator  38.77 
 
 		 661 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2340  RNase II stability modulator  38.77 
 
 		 661 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1842  RNase II stability modulator  38.77 
 
 		 661 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0112439  hitchhiker  0.00000000000000244061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1888  RNase II stability modulator  40.58 
 
 		 663 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000553468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1831  RNase II stability modulator  40.1 
 
 		 660 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238279  decreased coverage  0.000176038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1447  RNase II stability modulator  40.58 
 
 		 663 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00630627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1629  RNase II stability modulator  40.58 
 
 		 663 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0924134  hitchhiker  2.42351e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1826  RNase II stability modulator  40.1 
 
 		 663 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.47991e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1550 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 592 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 592 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 592 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2740  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.77 
 
 		 1016 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 591 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7540  hypothetical protein  31.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.0121874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 1028 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1382  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.2 
 
 		 889 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231857  normal  0.133175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 1043 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 1144 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 1399 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 1267 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>