17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7540 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7540  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  259  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.0121874 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6700  hypothetical protein  34.07 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.874076 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5577  hypothetical protein  30.93 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5941  hypothetical protein  30.93 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6443  hypothetical protein  30.93 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7252  hypothetical protein  30.56 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922798  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1152  RNase II stability modulator  30.93 
 
 
667 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.584939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5279  RNase II stability modulator  30.11 
 
 
666 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164085  normal  0.0978812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5454  RNase II stability modulator  29.9 
 
 
689 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5285  RNase II stability modulator  28.89 
 
 
667 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445502  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3462  RNase II stability modulator  27.78 
 
 
667 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347087  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2573  RNase II stability modulator  27.27 
 
 
667 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4742  RNase II stability modulator  26.74 
 
 
664 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.632651  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3966  RNase II stability modulator  27.27 
 
 
667 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0378593  normal  0.0378362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3554  RNase II stability modulator  27.91 
 
 
667 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108406  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7539  PAS sensor protein  31.33 
 
 
316 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0148723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5122  RNase II stability modulator  26.14 
 
 
667 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0232161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>