15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5577 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5577  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  278  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5941  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  278  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6443  hypothetical protein  98.5 
 
 
134 aa  273  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6700  hypothetical protein  83.97 
 
 
131 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.874076 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7252  hypothetical protein  77.69 
 
 
146 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922798  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7540  hypothetical protein  30.93 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.0121874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4742  RNase II stability modulator  30.93 
 
 
664 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.632651  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5279  RNase II stability modulator  32.18 
 
 
666 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164085  normal  0.0978812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3462  RNase II stability modulator  30.77 
 
 
667 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347087  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5285  RNase II stability modulator  30.77 
 
 
667 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445502  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3966  RNase II stability modulator  30.77 
 
 
667 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0378593  normal  0.0378362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5122  RNase II stability modulator  30.77 
 
 
667 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0232161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2573  RNase II stability modulator  29.67 
 
 
667 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3554  RNase II stability modulator  30.77 
 
 
667 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108406  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5454  RNase II stability modulator  27 
 
 
689 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>