More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6261 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6428  sodium:dicarboxylate symporter  96.85 
 
 		 444 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5625  sodium:dicarboxylate symporter  87.06 
 
 		 440 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0953084 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6373  sodium:dicarboxylate symporter  85.48 
 
 		 423 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6663  sodium:dicarboxylate symporter  96.85 
 
 		 444 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6261  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 444 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5522  sodium:dicarboxylate symporter  80.46 
 
 		 433 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.360968 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6010  sodium:dicarboxylate symporter  82.48 
 
 		 436 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2056  sodium:dicarboxylate symporter  57.66 
 
 		 439 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3684  sodium:dicarboxylate symporter  57.66 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3162  sodium:dicarboxylate symporter  56.45 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1270  aerobic C4-dicarboxylate transport protein  57.18 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1575  sodium:dicarboxylate symporter  54.5 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120491  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.98 
 
 		 450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.82 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  51.75 
 
 		 460 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.59 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.73 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.68 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.66 
 
 		 440 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  53.94 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.52 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.44 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.14 
 
 		 440 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  49.88 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  49.88 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  49.76 
 
 		 439 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.46 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.57 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  52.8 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  52.31 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.12 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  51.48 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.08 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  51.48 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  51.89 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  51.89 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.71 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  51.89 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  51.48 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  48.24 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  52.23 
 
 		 425 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  48.6 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.94 
 
 		 430 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 		 451 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.41 
 
 		 429 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.74 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.72 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.51 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  50.25 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  49.08 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.26 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  50.25 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.42 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09460  C4-dicarboxylate transport protein  51.69 
 
 		 433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.81039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.26 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.55 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.49 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  49.75 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  48.51 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.5 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.36 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.27 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.66 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.19 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.69 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.88 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.49 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.8 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.12 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  49.39 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  49.75 
 
 		 455 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  47.48 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.79 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.21 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.56 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.43 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.19 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.79 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.44 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.19 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.79 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.54 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>