More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6517 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  98.13 
 
 
375 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  96.27 
 
 
375 aa  703    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
375 aa  749    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  95.47 
 
 
375 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
375 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  78.82 
 
 
375 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  73.5 
 
 
374 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.58 
 
 
368 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.46 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 
376 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.07 
 
 
368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  55.22 
 
 
366 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.62 
 
 
368 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.99 
 
 
374 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  53.17 
 
 
365 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  47.11 
 
 
364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
373 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
363 aa  348  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  50.69 
 
 
368 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  48.9 
 
 
364 aa  342  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  50.69 
 
 
366 aa  342  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 
370 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.45 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  51.24 
 
 
366 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.73 
 
 
381 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  51.82 
 
 
368 aa  318  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.72 
 
 
362 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  44.66 
 
 
368 aa  310  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
365 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 
372 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  46.03 
 
 
363 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
365 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  39.85 
 
 
387 aa  262  8e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.6 
 
 
361 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  45.08 
 
 
370 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  39.34 
 
 
326 aa  256  6e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.05 
 
 
358 aa  255  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.08 
 
 
371 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.44 
 
 
368 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  37.47 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 
379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
361 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  36.12 
 
 
376 aa  218  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  36.66 
 
 
382 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
366 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.77 
 
 
372 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
376 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.2 
 
 
375 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
376 aa  216  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.13 
 
 
372 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.49 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  37.13 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  36.12 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.97 
 
 
361 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  35.58 
 
 
379 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
374 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
375 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
373 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.23 
 
 
370 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.39 
 
 
369 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
385 aa  209  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
374 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
371 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  37.14 
 
 
359 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  36.31 
 
 
372 aa  209  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0483  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
368 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27799  hitchhiker  0.00130269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
362 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.58 
 
 
384 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.67 
 
 
361 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  35.58 
 
 
382 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  36.59 
 
 
370 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.77 
 
 
382 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3253  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
368 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1230  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
368 aa  206  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.236106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
370 aa  205  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.28 
 
 
374 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
368 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4000  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.43 
 
 
368 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  35.85 
 
 
371 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
361 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
368 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.5 
 
 
376 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0536  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.42 
 
 
371 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262053  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
370 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>