More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1956 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
365 aa  742    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  64.03 
 
 
370 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.68 
 
 
368 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  47.27 
 
 
366 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.86 
 
 
368 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.36 
 
 
368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
368 aa  323  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.81 
 
 
368 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.6 
 
 
374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.68 
 
 
363 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  47.03 
 
 
375 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  45.61 
 
 
375 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  47.03 
 
 
375 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  42.27 
 
 
364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 
375 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 
375 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
368 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 
366 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.26 
 
 
375 aa  302  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  43.68 
 
 
366 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
365 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
376 aa  295  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  43.01 
 
 
374 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.48 
 
 
381 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
373 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.25 
 
 
362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  41.5 
 
 
364 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.11 
 
 
371 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 
372 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.62 
 
 
365 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
363 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  42.09 
 
 
368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.42 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.34 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05434  conserved hypothetical protein  39.78 
 
 
380 aa  229  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.106976  normal  0.0393191 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  34.52 
 
 
326 aa  222  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  35.79 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.92 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.59 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  36.8 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.69 
 
 
384 aa  219  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
373 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
373 aa  219  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  35.15 
 
 
372 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  36.04 
 
 
382 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  37.81 
 
 
374 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
374 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
376 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.29 
 
 
375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  35.23 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
379 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
379 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.96 
 
 
379 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
379 aa  215  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
379 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.29 
 
 
375 aa  215  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  34.69 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  35.23 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.22 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  34.96 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.73 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.23 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  35.23 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  37.6 
 
 
379 aa  212  9e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0144  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.59 
 
 
370 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
370 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.77 
 
 
372 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
373 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
375 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
376 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.31 
 
 
358 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
370 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.42 
 
 
376 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
370 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
376 aa  209  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4034  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
369 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
373 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  34.33 
 
 
377 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.79 
 
 
370 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.69 
 
 
368 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
376 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0169  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
371 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0241  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
371 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667436  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.16 
 
 
361 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
370 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
372 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.6 
 
 
376 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  34.79 
 
 
370 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
376 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>