More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6807 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
361 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  45.92 
 
 
375 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 
375 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.29 
 
 
368 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 
375 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 
375 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 
375 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 
368 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.04 
 
 
362 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.08 
 
 
368 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.25 
 
 
368 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  46.47 
 
 
373 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 
374 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  42.58 
 
 
365 aa  275  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  40.66 
 
 
366 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.87 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
364 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.58 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.7 
 
 
365 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.63 
 
 
358 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 
368 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 
363 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.88 
 
 
376 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.54 
 
 
375 aa  255  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.19 
 
 
371 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  39.67 
 
 
364 aa  245  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 
366 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  38.96 
 
 
370 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.98 
 
 
381 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
368 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
365 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  40.76 
 
 
366 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.67 
 
 
371 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  33.85 
 
 
387 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
374 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  34.84 
 
 
379 aa  180  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.61 
 
 
368 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3061  alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
374 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  33.23 
 
 
334 aa  175  9e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0995  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.48 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0675195  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05434  conserved hypothetical protein  35.46 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.106976  normal  0.0393191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10776  zinc-type alcohol dehydrogenase NAD dependent adhB  34.05 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  31.37 
 
 
376 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  30.65 
 
 
372 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.71 
 
 
372 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
403 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
373 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.82 
 
 
375 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  35.14 
 
 
361 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.99 
 
 
384 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
363 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
373 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3128  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.2 
 
 
376 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
375 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
376 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3947  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.98 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.607291  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  32.96 
 
 
326 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
374 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4588  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
368 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
373 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
379 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
379 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  30.83 
 
 
379 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
379 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
379 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
376 aa  165  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  30.38 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3448  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.59 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5014  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.67 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29252  Glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase (FDH) (FALDH) (FLD)  31.45 
 
 
378 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.264188  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
379 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
379 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
379 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
366 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.97 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5164  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.69 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.46 
 
 
359 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  30.56 
 
 
376 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
370 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3840  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.96 
 
 
385 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  30.75 
 
 
377 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.27 
 
 
369 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.97 
 
 
361 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0127  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
374 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
361 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
375 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0137  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
374 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
370 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13103  zinc-type alcohol dehydrogenase adhD (aldehyde reductase)  33.33 
 
 
368 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.256708  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0146  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
374 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625258  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07750  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  40.69 
 
 
383 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.969259  normal  0.331312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>