More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2709 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
371 aa  734    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.69 
 
 
368 aa  292  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.61 
 
 
374 aa  292  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 
364 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  46.35 
 
 
375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
376 aa  285  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  46.07 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.79 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  45.79 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
375 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.14 
 
 
375 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  44.63 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  41.37 
 
 
366 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.7 
 
 
363 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
365 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
368 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
364 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  44.09 
 
 
373 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.66 
 
 
368 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 
368 aa  256  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 
368 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  44.06 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  45.88 
 
 
366 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  40.22 
 
 
368 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  41.92 
 
 
365 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.05 
 
 
371 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
366 aa  236  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.41 
 
 
362 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.65 
 
 
381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.27 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40 
 
 
372 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  43.06 
 
 
368 aa  215  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  43.13 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.29 
 
 
358 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 
363 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
361 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05434  conserved hypothetical protein  35.69 
 
 
380 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.106976  normal  0.0393191 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  35.59 
 
 
387 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  33.63 
 
 
334 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.97 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  39.48 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 
326 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.9 
 
 
369 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
362 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.24 
 
 
369 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.64 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
374 aa  166  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  32.88 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2089  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  0.876446 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  34.74 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
366 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.97 
 
 
361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.69 
 
 
368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.71 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.04 
 
 
361 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
379 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
379 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
379 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  33.43 
 
 
382 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.95 
 
 
362 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
379 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
379 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
379 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
373 aa  162  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
379 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.14 
 
 
379 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2889  histidine kinase  30.95 
 
 
368 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834376  hitchhiker  0.00334697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.42 
 
 
362 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.07 
 
 
361 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  32.86 
 
 
376 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  32.86 
 
 
379 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
370 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.3 
 
 
361 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
376 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1978  alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
367 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
376 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  32.89 
 
 
376 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
368 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
373 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  32.55 
 
 
371 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.69 
 
 
361 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0069  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  31.35 
 
 
368 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.02 
 
 
368 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.07 
 
 
375 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
373 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  32.19 
 
 
370 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4000  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.35 
 
 
368 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  33.99 
 
 
377 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
370 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
361 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
374 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0144  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.25 
 
 
370 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1179  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  30.22 
 
 
370 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457911  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
368 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  33.99 
 
 
370 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>