More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2120 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
366 aa  742    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  77.6 
 
 
366 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.04 
 
 
368 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.47 
 
 
368 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  49.45 
 
 
366 aa  355  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  49.31 
 
 
374 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  50.28 
 
 
375 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  51.13 
 
 
375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.03 
 
 
374 aa  342  7e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  50.85 
 
 
375 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.28 
 
 
375 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  50.28 
 
 
375 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.59 
 
 
375 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
363 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  46.85 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 
368 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  46.45 
 
 
370 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.33 
 
 
368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 
365 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  43.72 
 
 
368 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
373 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.17 
 
 
381 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.54 
 
 
362 aa  288  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  43.72 
 
 
368 aa  288  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.22 
 
 
371 aa  288  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  42.5 
 
 
364 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.92 
 
 
372 aa  269  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 
370 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  42.08 
 
 
363 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
368 aa  242  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.89 
 
 
365 aa  239  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.26 
 
 
368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  36.24 
 
 
387 aa  227  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  36.64 
 
 
326 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 
373 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  37.76 
 
 
334 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  37.57 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.49 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.05 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  36.76 
 
 
376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
376 aa  212  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.96 
 
 
384 aa  211  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  36.89 
 
 
382 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  35.95 
 
 
379 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.07 
 
 
382 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  36.02 
 
 
376 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.02 
 
 
376 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.57 
 
 
358 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  37.03 
 
 
382 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  35.83 
 
 
376 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
376 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
379 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
379 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
379 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  35.75 
 
 
376 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.75 
 
 
376 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
374 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
376 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
376 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  36.68 
 
 
377 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
370 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.53 
 
 
371 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
368 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
385 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.22 
 
 
372 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
368 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
370 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
375 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.68 
 
 
374 aa  205  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.48 
 
 
370 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
376 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
370 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0069  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  36.19 
 
 
368 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.68 
 
 
375 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 
373 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.29 
 
 
372 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
368 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3427  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
376 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.41 
 
 
370 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.32 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  34.86 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  34.86 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3418  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128659  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  35.48 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0605  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  35.12 
 
 
368 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  0.42713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>