More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0089 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
368 aa  746    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.88 
 
 
371 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.73 
 
 
368 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.27 
 
 
368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.54 
 
 
368 aa  348  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 
375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  47.92 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
375 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 
375 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.42 
 
 
375 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  50.42 
 
 
375 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.87 
 
 
374 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.8 
 
 
368 aa  331  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
373 aa  311  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
365 aa  308  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  44.9 
 
 
374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  43.41 
 
 
364 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 
368 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
363 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.15 
 
 
375 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
365 aa  289  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  46.85 
 
 
363 aa  288  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.9 
 
 
362 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.53 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 
376 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  43.72 
 
 
366 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  44.54 
 
 
366 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.12 
 
 
381 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.88 
 
 
358 aa  252  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.94 
 
 
361 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  41.73 
 
 
370 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.32 
 
 
365 aa  246  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  41.06 
 
 
368 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  35.37 
 
 
387 aa  216  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.51 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.95 
 
 
371 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  36.93 
 
 
326 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05434  conserved hypothetical protein  34.06 
 
 
380 aa  209  8e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.106976  normal  0.0393191 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  36.74 
 
 
379 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.93 
 
 
384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  33.87 
 
 
376 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  32.89 
 
 
372 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.3 
 
 
368 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
376 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  34.38 
 
 
359 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
374 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 
370 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  32.53 
 
 
376 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
376 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
370 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
373 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
373 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.26 
 
 
370 aa  185  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
368 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0144  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.1 
 
 
370 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.72 
 
 
372 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  33.14 
 
 
334 aa  184  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 
359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07750  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  35.46 
 
 
383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.969259  normal  0.331312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2527  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0605767  normal  0.410127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
372 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
379 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
379 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
362 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
379 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3587  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
369 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0069  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  30.11 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2495  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 
369 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.584099  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  32.26 
 
 
379 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  31.99 
 
 
382 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.54 
 
 
371 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.99 
 
 
382 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0605  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  30.38 
 
 
368 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  32.26 
 
 
376 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
379 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.38 
 
 
368 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
379 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  32.8 
 
 
376 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
379 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
373 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  32.8 
 
 
379 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
379 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  32.53 
 
 
377 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4000  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.11 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  31.27 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.45 
 
 
376 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
375 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.18 
 
 
375 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
375 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
379 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  31.45 
 
 
382 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
379 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4957  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
370 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>