More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  100 
 
 
366 aa  743    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  77.6 
 
 
366 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.92 
 
 
368 aa  368  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.95 
 
 
368 aa  361  9e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  49.04 
 
 
364 aa  355  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
374 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  51.99 
 
 
375 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  51.7 
 
 
375 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  51.14 
 
 
375 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  48.08 
 
 
366 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.14 
 
 
375 aa  344  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.85 
 
 
375 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  50.85 
 
 
375 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  47.12 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.6 
 
 
374 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 
376 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.67 
 
 
363 aa  323  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 
368 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.6 
 
 
368 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  45.88 
 
 
373 aa  308  9e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  43.68 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  44.11 
 
 
368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 
368 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.59 
 
 
362 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.54 
 
 
381 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
364 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.81 
 
 
371 aa  273  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.67 
 
 
372 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  46.52 
 
 
368 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  43.01 
 
 
363 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.32 
 
 
368 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  38.63 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.26 
 
 
365 aa  242  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 
370 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  36.74 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  39.25 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.93 
 
 
376 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
379 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
379 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
379 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 
373 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  38.38 
 
 
382 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  36.12 
 
 
379 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  38.11 
 
 
382 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  36.97 
 
 
372 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
370 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.57 
 
 
382 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.9 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
375 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
374 aa  225  9e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.31 
 
 
376 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.12 
 
 
370 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.12 
 
 
371 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  35.85 
 
 
376 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
370 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.85 
 
 
370 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.85 
 
 
370 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
376 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  36.56 
 
 
376 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
376 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
376 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
374 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  35.85 
 
 
376 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.7 
 
 
372 aa  222  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
376 aa  222  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  36.39 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.17 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
373 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1367  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.66 
 
 
370 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.85 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  35.04 
 
 
376 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.12 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3427  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  35.58 
 
 
377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
370 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
376 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.41 
 
 
374 aa  216  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
373 aa  215  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.31 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  35.2 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.5 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5970  alcohol dehydrogenase class III  35.2 
 
 
369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.66491 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  35.1 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 
362 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
376 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.5 
 
 
369 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04416  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
369 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
370 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>