More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1578 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
368 aa  746    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.04 
 
 
363 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  51.51 
 
 
364 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.12 
 
 
368 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.45 
 
 
368 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.12 
 
 
368 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  47.27 
 
 
366 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  47.14 
 
 
365 aa  332  5e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.72 
 
 
368 aa  325  9e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 
370 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.99 
 
 
374 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
374 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.66 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  46.07 
 
 
375 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 
375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  45.79 
 
 
375 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
375 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
375 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 
368 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.38 
 
 
375 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
364 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.01 
 
 
362 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
373 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  43.72 
 
 
366 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.03 
 
 
381 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  44.11 
 
 
366 aa  278  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.62 
 
 
365 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  40.39 
 
 
363 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
372 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.21 
 
 
371 aa  262  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  42.05 
 
 
368 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  37.8 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 
370 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.31 
 
 
361 aa  228  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  38.5 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  38.92 
 
 
334 aa  220  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05434  conserved hypothetical protein  35.84 
 
 
380 aa  219  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.106976  normal  0.0393191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.45 
 
 
371 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.05 
 
 
358 aa  215  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2089  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
372 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  0.876446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.17 
 
 
375 aa  206  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.66 
 
 
384 aa  206  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.58 
 
 
375 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
373 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  34.85 
 
 
376 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
373 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0241  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
371 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667436  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0169  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
371 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  34.32 
 
 
376 aa  202  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
374 aa  202  7e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  35.31 
 
 
359 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.61 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.83 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.56 
 
 
375 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 
362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
379 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
379 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
379 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
373 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
370 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  34.05 
 
 
382 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
376 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  34.59 
 
 
370 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  34.32 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.43 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.78 
 
 
372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.05 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  33.24 
 
 
372 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.28 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.95 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
385 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  34.05 
 
 
376 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.24 
 
 
366 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
380 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  34.32 
 
 
377 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
361 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.16 
 
 
370 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
362 aa  194  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.22 
 
 
369 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  33.24 
 
 
382 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
360 aa  193  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
376 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  193  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.88 
 
 
361 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>