More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4351 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0775  cytochrome P450-like  84.22 
 
 		 391 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450632  normal  0.0182279 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4351  cytochrome P450-like protein  100 
 
 		 393 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000524199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4867  cytochrome P450-like protein  96.44 
 
 		 393 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339556  hitchhiker  0.00002837 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3450  cytochrome P450-like  83.21 
 
 		 389 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4916  cytochrome P450-like protein  83.21 
 
 		 389 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.036894  normal  0.254333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5370  cytochrome P450-like protein  83.21 
 
 		 389 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0443173  normal  0.121886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3696  cytochrome P450-like protein  77.1 
 
 		 392 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.427922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3472  putative cytochrome p450 oxidoreductase  42.08 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.19451  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4960  cytochrome P450-like protein  45.09 
 
 		 380 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3094  putative cytochrome P450 oxidoreductase  37.98 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5115  putative cytochrome p450 oxidoreductase  41.31 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341352  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3820  putative cytochrome p450 oxidoreductase  39.65 
 
 		 383 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4372  putative cytochrome p450 oxidoreductase  37.94 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.452349 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4262  cytochrome P450-like protein  37.94 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2807  putative cytochrome p450 oxidoreductase  34.64 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.59 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  28.61 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  30.75 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  31 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  28.14 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  29.06 
 
 		 402 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  27.67 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  26.29 
 
 		 412 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0556  cytochrome P450 enzyme  26.47 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  31.02 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0542  cytochrome P450  26.47 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.353046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  26.51 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  28.57 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  30.38 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  29.31 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  30.38 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  28.65 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  30.38 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  26.91 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  32.41 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  28.3 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  32.34 
 
 		 423 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  25.28 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  28.88 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  28.97 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  25.31 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  28.61 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.17 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  32.63 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  28.46 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  29.25 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  28.1 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  28.85 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  27.4 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  25.97 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  26.93 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  26.65 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1769  cytochrome P450  28.57 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  25.68 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  25.94 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  27.57 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  28.52 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  27.47 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  28.3 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  29.03 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  25.91 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  26.13 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  27.7 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  26.82 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  25.57 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  27.86 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  29.74 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  27.34 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  25.54 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  24.05 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  27.03 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  25.53 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  27.99 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  26.11 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  27.01 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  25.28 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  25.28 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  25.28 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2042  cytochrome P450  31.76 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  26.11 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6329  cytochrome P450  31.05 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  33.77 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  24.83 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  23.94 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  25.85 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  25.84 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  29.22 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  24.66 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  24.47 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  26.67 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  31.18 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  30.12 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  27.95 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  26.72 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  27.18 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  25 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  33.05 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  26.23 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0364  cytochrome P450  25.88 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  28.61 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>