39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4171 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  96.44 
 
 		 225 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  87.61 
 
 		 229 aa  370  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  91.18 
 
 		 227 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  93.33 
 
 		 233 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  93.33 
 
 		 233 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  93.33 
 
 		 233 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  50.98 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  44.12 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  41.67 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  40.78 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  40.1 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  40.41 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  39.27 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  41.58 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  38.59 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  34.25 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  33.88 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  34.35 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  27.66 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  33.88 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  36.7 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  33.03 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  40.98 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6054  hypothetical protein  39.34 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5690  hypothetical protein  39.34 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  32.11 
 
 		 186 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  38.33 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  31.19 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  28.23 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  40 
 
 		 176 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2638  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2124  hypothetical protein  36.11 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1475  hypothetical protein  34.43 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3249  hypothetical protein  34.55 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  hitchhiker  0.000758409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>