32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4398 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  94.32 
 
 		 176 aa  336  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7232  hypothetical protein  54.65 
 
 		 180 aa  184  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106534 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  56.07 
 
 		 176 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1475  hypothetical protein  54.19 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5690  hypothetical protein  55.49 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6054  hypothetical protein  55.49 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  52.6 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  52.6 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  51.45 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  51.16 
 
 		 181 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1676  hypothetical protein  45.66 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.991452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2009  hypothetical protein  45.66 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1883  hypothetical protein  43.09 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  41.67 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3151  hypothetical protein  41.18 
 
 		 88 aa  47.8  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  38.33 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  38.33 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2124  hypothetical protein  34.52 
 
 		 112 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  41.07 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  36.21 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  36.21 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  38.1 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3249  hypothetical protein  32.26 
 
 		 232 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  hitchhiker  0.000758409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  39.29 
 
 		 223 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  39.29 
 
 		 217 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  33.9 
 
 		 222 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  35.59 
 
 		 224 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>