27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5793 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  473  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  93.07 
 
 		 231 aa  443  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  34.07 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  36.08 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  33.68 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  33.85 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  36.02 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  32.2 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  28.96 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  28.74 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  27.13 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  32.78 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  32.78 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  33.88 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  33.88 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  33.93 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  31.07 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  26.72 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  29.69 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2143  hypothetical protein  33.75 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10520  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11570)  27.96 
 
 		 545 aa  48.5  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  36.21 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  38.46 
 
 		 110 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>