29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3447 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  57.6 
 
 
217 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  36.36 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  34.88 
 
 
224 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  35.44 
 
 
221 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  39.55 
 
 
229 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  49.57 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  38.98 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  48.72 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  38.98 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  38.98 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  38.98 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  39.1 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  31.7 
 
 
223 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  32.86 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  37.01 
 
 
222 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  34.31 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  27.59 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  33.59 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  26.72 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  33.06 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  25.66 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2124  hypothetical protein  34.18 
 
 
112 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  23.67 
 
 
221 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10520  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11570)  31.88 
 
 
545 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  36.67 
 
 
176 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  29.09 
 
 
181 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2638  hypothetical protein  32.2 
 
 
113 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8417  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2122  hypothetical protein  37.04 
 
 
230 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>