20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2124 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2124  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  228  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  34.18 
 
 
217 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  36.36 
 
 
217 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  34.29 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  37.5 
 
 
233 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  37.5 
 
 
233 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  34.52 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  37.5 
 
 
233 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  35.14 
 
 
225 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3249  hypothetical protein  31.94 
 
 
232 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  hitchhiker  0.000758409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  36.11 
 
 
225 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0349  hypothetical protein  40.38 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  44.44 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  36.73 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1622  hypothetical protein  36.99 
 
 
290 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  38.24 
 
 
247 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  34.09 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  30.68 
 
 
186 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>