38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4786 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  90.05 
 
 
225 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  88.53 
 
 
229 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  90.5 
 
 
225 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  91.67 
 
 
227 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  50.98 
 
 
229 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  44.61 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  39.13 
 
 
217 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  41.45 
 
 
224 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  40.21 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  39.89 
 
 
223 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  41.27 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  38.25 
 
 
217 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  38.17 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  34.01 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  33.88 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  32.26 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  35.34 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  33.06 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  35.78 
 
 
181 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7232  hypothetical protein  32.48 
 
 
180 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.106534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  32.11 
 
 
181 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  40.98 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6054  hypothetical protein  39.34 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352662  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5690  hypothetical protein  39.34 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  31.19 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  38.33 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  29.03 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  31.37 
 
 
181 aa  48.5  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1883  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  42.86 
 
 
110 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2124  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1475  hypothetical protein  34.43 
 
 
179 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2638  hypothetical protein  36.84 
 
 
113 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>