32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6856 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  224  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2979  hypothetical protein  34.86 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3367  hypothetical protein  33.03 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0349  hypothetical protein  43.75 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  47.89 
 
 		 244 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4024  hypothetical protein  38.16 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.437309  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  36.62 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  38.67 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2638  hypothetical protein  43.14 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  34.38 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  34.78 
 
 		 217 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  34.25 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  32.79 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  42.86 
 
 		 233 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2124  hypothetical protein  34.29 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  42.86 
 
 		 233 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  42.86 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  42.86 
 
 		 233 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10520  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11570)  35.38 
 
 		 545 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  37.7 
 
 		 233 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  35.94 
 
 		 266 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  43.18 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  38.46 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  38.46 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  44.19 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3249  hypothetical protein  27.5 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  hitchhiker  0.000758409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1622  hypothetical protein  38.3 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2123  hypothetical protein  30.14 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>