29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1333 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  77.05 
 
 
247 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  35.75 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  35.23 
 
 
231 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  35.11 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  31.62 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  32.08 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  30.9 
 
 
224 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  32.63 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  38.13 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  37.4 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  37.78 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  37.78 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  37.78 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  38.46 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  37.68 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  36.96 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  36.43 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  45 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  32.85 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  30.41 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  31.9 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  47.89 
 
 
110 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  32.48 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10520  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11570)  34.33 
 
 
545 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2638  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8417  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2122  hypothetical protein  41.67 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  36.51 
 
 
176 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0349  hypothetical protein  40.38 
 
 
100 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>