24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4520 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  37.61 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  36.43 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  25.31 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  29.69 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  26.92 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  29.84 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  28.24 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  29.01 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  28.15 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  28.69 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  29.03 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  28.86 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  25.66 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  28.41 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  28.41 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  28.41 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  27.51 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  28.23 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  28.23 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  28.23 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  24.77 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  25.44 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  35.94 
 
 		 110 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>