27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5796 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  93.07 
 
 
231 aa  443  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  32.44 
 
 
233 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  34.36 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  30.4 
 
 
223 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  27.8 
 
 
223 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  32.31 
 
 
224 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  34.13 
 
 
244 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  33.17 
 
 
247 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  29.95 
 
 
221 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  28.92 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  26.6 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  33.88 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  33.88 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  33.88 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  33.88 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  32.71 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  33.88 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  31.69 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  34.26 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  31.25 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  27.59 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  24.51 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2143  hypothetical protein  33.75 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10520  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11570)  27.96 
 
 
545 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  36.21 
 
 
176 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  38.46 
 
 
110 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>