31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3903 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  57.6 
 
 
217 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  39.2 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  39.2 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  39.2 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  40.91 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  40.34 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  40.34 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  39.2 
 
 
227 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  50 
 
 
221 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  43.23 
 
 
224 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  44.59 
 
 
223 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  35.45 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  35.12 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  34.09 
 
 
224 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  32.98 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  27.13 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  26.6 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  34.51 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  38.46 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  32.47 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  30.3 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  28.15 
 
 
266 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2124  hypothetical protein  36.36 
 
 
112 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  34.78 
 
 
110 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  42.86 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2122  hypothetical protein  37.7 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3367  hypothetical protein  37.29 
 
 
106 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1622  hypothetical protein  28.57 
 
 
290 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2638  hypothetical protein  32.26 
 
 
113 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8417  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  39.29 
 
 
176 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>