36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4917 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  94.32 
 
 		 176 aa  336  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1475  hypothetical protein  52.51 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7232  hypothetical protein  52.91 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106534 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  54.34 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5690  hypothetical protein  53.76 
 
 		 176 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6054  hypothetical protein  53.76 
 
 		 176 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  51.45 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  50.29 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  49.42 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  49.71 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2009  hypothetical protein  46.82 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1676  hypothetical protein  46.82 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.991452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1883  hypothetical protein  41.44 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  38.33 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  38.33 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  38.33 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  38.33 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3151  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  42.86 
 
 		 221 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  41.27 
 
 		 247 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  36.67 
 
 		 227 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  36.67 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  42.86 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  41.07 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  37.29 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3249  hypothetical protein  35.48 
 
 		 232 aa  44.7  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  hitchhiker  0.000758409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  32.22 
 
 		 224 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  36.51 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  35.59 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  31.5 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  36.67 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2124  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  39.29 
 
 		 229 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0349  hypothetical protein  32.76 
 
 		 100 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>